PRJEB27079:接受安慰剂或阿奇霉素48周的重症哮喘患者混合痰液DNA提取物

接受安慰剂或阿奇霉素治疗48周的重症哮喘患者混合痰液DNA提取物(AMAZES试验)。主题标签:哮喘、重症哮喘、痰液DNA、阿奇霉素、安慰剂、AMAZES试验、呼吸系统疾病

ena
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基因组分类哮喘重症哮喘痰液DNA阿奇霉素安慰剂AMAZES试验呼吸系统疾病
PRJEB27079: Pooled sputum DNA extracts from patients with severe asthma who received either placebo or azithromycin for 48 weeks

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-02

资源简介

PRJEB27079:接受安慰剂或阿奇霉素48周的重症哮喘患者混合痰液DNA提取物

PRJEB27079 数据集收录的是重症哮喘患者的混合痰液 DNA 提取物,这些患者在接受治疗的过程中被分配至安慰剂组或阿奇霉素组,干预持续 48 周。该数据集来源于 AMAZES 试验,属于呼吸系统疾病领域中与哮喘相关的数据资源,可在 ebi.ac.uk 获取。从主题构成看,它围绕重症哮喘、痰液 DNA、阿奇霉素与安慰剂对照等关键词展开,适合作为研究重症哮喘患者痰液微生物组或相关分子特征的素材。数据集以混合痰液 DNA 提取物为核心对象,将临床干预分组信息与生物样本材料关联在一起,为后续分析提供了样本层面的基础。整体而言,该数据集面向重症哮喘这一特定患者群体,兼具临床试验背景与痰液样本属性,是呼吸系统疾病研究中一项具有明确来源和主题指向的数据资源。

【数据集背景】

该数据集对应 AMAZES 试验,研究对象为重症哮喘患者。试验中,患者分别接受安慰剂或阿奇霉素治疗,治疗周期为 48 周。数据集所关注的样本类型为混合痰液 DNA 提取物,即从患者痰液样本中提取的 DNA 材料。重症哮喘是哮喘中病情较重的一类,痰液则是呼吸道研究中常用的样本来源之一。该数据集将临床试验的干预设计与痰液 DNA 样本结合起来,形成具有特定临床背景的样本集合。其来源站为 ebi.ac.uk,分类归属呼吸系统疾病下的哮喘方向。

【数据内容】

数据集的内容为混合痰液 DNA 提取物,来自接受安慰剂或阿奇霉素治疗 48 周的重症哮喘患者。样本材料以 DNA 提取物的形式存在,并对应患者的治疗分组信息。主题标签涵盖哮喘、重症哮喘、痰液 DNA、阿奇霉素、安慰剂、AMAZES 试验以及呼吸系统疾病。数据集中不包含源站未提供的其他类型数据说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 AMAZES 试验,样本采集对象为重症哮喘患者,采集的样本为痰液,并制备为混合痰液 DNA 提取物。患者在接受安慰剂或阿奇霉素治疗 48 周的背景下提供样本。数据集的来源站为 ebi.ac.uk。关于具体的采集时间点、采集流程、样本量等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与重症哮喘相关的痰液 DNA 研究,例如围绕阿奇霉素干预与安慰剂对照条件下痰液样本的比较分析。由于样本材料为混合痰液 DNA 提取物,可用于需要痰液 DNA 作为输入的研究场景。其临床试验背景也使其适合用于关注治疗分组与呼吸道样本特征之间关系的研究。具体分析类型与适用范围需结合源站信息确定,源站未提供更详细的适用说明。

【使用方法】

数据集以混合痰液 DNA 提取物为内容,使用时应结合患者的治疗分组信息(安慰剂或阿奇霉素,治疗 48 周)进行组织与分析。关于数据下载方式、文件格式、数据处理流程等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于 AMAZES 试验的重症哮喘患者样本,样本类型为混合痰液 DNA 提取物。关于数据质量指标、样本量、缺失情况、批次信息等,源站未提供。使用时应注意到数据集仅覆盖接受安慰剂或阿奇霉素治疗 48 周的重症哮喘患者这一特定人群,其结论外推需谨慎。

【引用与许可】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,对应 AMAZES 试验。关于引用方式与许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB27079

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Pooled sputum DNA extracts from patients with severe asthma who received either placebo or azithromycin for 48 weeks (AMAZES trial)

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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