通风率对美洲原住民哮喘儿童家庭中哮喘相关微生物与过敏原的影响:空气及表面相关细菌与真菌群落研究

由于两个采样期(夏季和冬季)通风变化,患有哮喘的Cherokee nation儿童家庭中真菌和细菌微生物组发生的变化。主题标签:哮喘、通风率、微生物组、真菌群落、细菌群落、室内环境、美洲原住民儿童

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其他哮喘通风率微生物组真菌群落细菌群落室内环境美洲原住民儿童
PRJEB26928: The Influence of Ventilation Rates on Microbes Associated with Asthma &amp Allergens in Homes of Native American Children: A Study of Airborne &amp Surface-Associated Bacterial &amp Fungal Communities

基本信息

模态
其他
创建/更新时间
2026-11-02

资源简介

通风率对美洲原住民哮喘儿童家庭中哮喘相关微生物与过敏原的影响:空气及表面相关细菌与真菌群落研究

PRJEB26928 数据集聚焦于住宅通风条件与哮喘相关微生物及过敏原之间的关联,研究对象为美洲原住民(切罗基族)哮喘患儿所居住的家庭。该数据集同时关注空气中的与表面附着的细菌和真菌群落,通过在夏季和冬季两个采样期开展采样,考察通风率变化如何引起真菌和细菌微生物组的改变。数据集归属于呼吸系统疾病中的哮喘方向,来源于欧洲生物信息研究所(EBI)数据库,主题涵盖哮喘、通风率、微生物组、真菌群落、细菌群落、室内环境以及美洲原住民儿童等关键词,可为室内环境微生物学与呼吸系统健康相关研究提供数据基础。

【数据集背景】

哮喘是一种常见的慢性呼吸系统疾病,室内环境中的微生物和过敏原暴露被认为与哮喘症状的发生和加重有关。住宅通风状况会直接影响室内空气与表面的微生物群落组成,从而可能改变居住者尤其是儿童的暴露特征。该数据集正是针对这一科学问题而建立,选取患有哮喘的切罗基族(Cherokee nation)儿童家庭作为研究对象,通过比较不同通风条件下的微生物群落,探讨通风率对与哮喘相关的微生物及过敏原的影响。研究同时覆盖空气传播和表面附着两类微生物样本,并区分细菌与真菌两大类群,以较全面地刻画室内微生物暴露格局。

【数据内容】

该数据集包含来自切罗基族哮喘患儿家庭的真菌和细菌微生物组数据,样本涉及两个采样期,即夏季和冬季。数据覆盖空气传播的微生物与表面附着的微生物两种样本类型,并分别针对细菌群落和真菌群落进行测定。数据集的核心内容是不同通风条件下微生物群落组成的变化信息,用于反映通风率改变所导致的真菌与细菌微生物组移位。关于具体的样本数量、测序平台、序列数据量、物种分类单元数目等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于对切罗基族哮喘患儿居住家庭的实际采样,采样在夏季和冬季两个时期进行,以捕捉不同季节通风状况差异下的微生物群落特征。样本类型包括空气传播样本和表面附着样本,测定对象为细菌与真菌群落。数据集通过欧洲生物信息研究所(EBI)的数据库对外发布,标识为 PRJEB26928。关于采样点的具体地理位置、采样设备、采样时长与频率、样本处理流程等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于室内环境微生物学与呼吸系统健康交叉领域的研究,例如分析通风率变化对室内细菌和真菌群落结构的影响、比较空气传播与表面附着微生物群落的差异、探讨季节(夏季与冬季)变化下室内微生物组的动态,以及研究与哮喘相关的微生物暴露特征。也可用于美洲原住民儿童居住环境健康相关的研究,或作为室内微生物组与过敏原联合分析的参考数据。关于该数据集是否适用于其他特定分析目的,源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过 EBI 数据库获取该数据集,并依据其提供的微生物组信息开展细菌与真菌群落层面的比较分析,例如按采样季节(夏季、冬季)或按样本类型(空气传播、表面附着)进行分组比较。关于具体的下载方式、文件格式、数据组织结构和分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于夏季和冬季两个采样期的实际家庭采样,样本来自切罗基族哮喘患儿家庭,研究对象具有特定的人群与地域背景。关于样本量大小、数据完整性、测序质量、是否存在缺失数据或批次效应等质量相关信息,源站未提供。使用时应结合研究目的谨慎解释结果,关于数据的具体局限性,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集发布于欧洲生物信息研究所(EBI)数据库,标识为 PRJEB26928。关于数据集的引用方式、许可协议及使用条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB26928

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在两个采样期(夏季和冬季)内,因通风变化导致的真菌和细菌微生物组变化,研究对象为有哮喘患儿的切罗基族家庭。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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