PRJEB15533：与特应性、哮喘及吸入性糖皮质激素治疗反应相关的支气管细菌微生物组特征

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB15533

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数据说明

背景：支气管细菌微生物群的组成差异与哮喘相关，但这些发现究竟归因于哮喘、气源性变应原致敏还是吸入性糖皮质激素治疗，目前尚不清楚。目的：比较未使用类固醇的特应性哮喘（AA）成人、有特应性但无哮喘（ANA）成人以及非特应性健康受试者（HC）的支气管细菌微生物群，并确定支气管微生物群与哮喘表型特征之间的关系。方法：通过16S rRNA基因测序对42例AA、21例ANA和21例HC受试者的保护性支气管刷检标本中的细菌群落进行分析。分析细菌组成及由序列谱推断的群落水平功能，以比较组间差异。检查其与临床和炎症变量的关联，包括2型相关炎症标志物以及六周氟替卡松治疗后气道高反应性的变化。结果：三组之间的支气管微生物组存在显著差异。

哮喘受试者在嗜血杆菌属、奈瑟菌属、梭杆菌属、卟啉单胞菌属和鞘氨醇单胞菌科的成员中独特富集，而在莫吉杆菌科和乳杆菌目的成员中减少。哮喘相关的预测细菌功能差异包括氨基酸和短链脂肪酸代谢通路的参与。2型高哮喘受试者的支气管细菌负荷显著较低。在氟替卡松治疗后，观察到特定微生物群成员的明显变化。类固醇反应性与细菌微生物组基线组成和功能特征的差异相关。结论：即使在轻度未使用类固醇的哮喘受试者中，支气管微生物组的差异也与该疾病的免疫学和临床特征相关。所确定的具体差异提示了未来哮喘治疗方法可能的微生物组靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。