NF-κB、氧化应激与TGF-β多基因风险评分的锁定通路基因集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23482962

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 6.1 KB。

数据说明

该存储库包含用于构建通路限制性多基因风险评分的锁定基因集，这些评分针对NF-κB信号传导、氧化应激和TGF-β信号传导，用于哮喘严重程度和疾病负担分析。基因集在结局关联分析之前即已确定。对于每条通路，基因通过预先指定的Molecular Signatures Database、MSigDB、Hallmark和Reactome术语合并，并附有一份预先指定的小型锚定基因补充列表。允许通路之间存在重叠，且不根据下游关联结果重新分配或移除基因。基因符号使用org.Hs.eg.db进行统一。直接HGNC SYMBOL映射予以保留。需要ALIAS映射的符号仅在别名唯一映射到一个获批符号时予以保留。模糊别名和未映射的输入被排除，并记录在随附的来源文件中。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。