ImmunoSPdb:免疫抑制肽数据库

主题标签:免疫抑制肽、哮喘、呼吸系统疾病、自身免疫疾病、器官移植、手工审编数据库。本站分类:呼吸系统疾病/哮喘。本数据集为呼吸系统疾病领域公开数据集,由Zenodo提供,主题涵盖免疫抑制肽。

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基因组预测免疫抑制肽哮喘呼吸系统疾病自身免疫疾病器官移植手工审编数据库
ImmunoSPdb: A repository of immuno-suppresive peptides

基本信息

模态
基因组
大小
0.000064944 GB
任务类型
预测
许可
MIT License
创建/更新时间
2026-10-07
版本
v1

资源简介

ImmunoSPdb:免疫抑制肽数据库

ImmunoSPdb(全称 ImmunoSPdb: A repository of immuno-suppresive peptides)是一个经过手工审编、面向免疫抑制肽的综合数据库,收录了经实验验证的免疫抑制肽相关信息。免疫抑制肽能够降低免疫系统的效能,在自身免疫疾病、哮喘治疗以及器官移植管理等领域具有广泛的治疗应用价值。该数据集由 Zenodo 提供,发布时间为 2019 年,采用 MIT License 许可,在站内被归类于呼吸系统疾病 / 哮喘方向,主题涵盖免疫抑制肽、哮喘、呼吸系统疾病、自身免疫疾病、器官移植以及手工审编数据库等标签,旨在为探索免疫应答调控肽的研究人员提供集中化的资源支持。

【数据集背景】

免疫抑制肽在降低免疫系统效能方面具有重要作用,其治疗应用范围广泛,尤其涉及自身免疫疾病、哮喘的治疗以及器官移植的管理。然而,相关研究长期缺乏一个集中化的资源平台。ImmunoSPdb 正是为满足这一需求而建立的,它为探索能够调节免疫应答的肽的研究人员提供了一个统一的资源入口。该数据库由 Sadullah Usmani、Salman、Aggarwal、piyush、Sehgal、Manika、Kumar Patel、Pradeep 以及 Raghava、Gajendra 等作者共同完成,机构来源为 Zenodo,发布时间为 2019 年。

【数据内容】

ImmunoSPdb 是一个综合性的、经过手工审编的数据库,收录的是经实验验证的免疫抑制肽。其主题覆盖免疫抑制肽、哮喘、呼吸系统疾病、自身免疫疾病、器官移植以及手工审编数据库等方向。该数据集在站内被归类为呼吸系统疾病 / 哮喘领域。关于数据的具体条目数量、字段结构、肽序列长度分布等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 doi.org,其官方文档提供了数据库的说明信息。数据库配有 Web 服务器,地址为 http://webs.iiitd.edu.in/raghava/immunospdb/,同时提供 GitHub 仓库,地址为 https://github.com/Manish-IIITD-repository/ImmunoSPdb。数据由 Zenodo 提供,发布时间为 2019 年。关于数据采集的具体流程、审编标准与更新机制,源站未提供。

【适用场景】

该数据库面向探索免疫应答调控肽的研究人员,适用于免疫抑制肽相关的研究工作。其主题覆盖自身免疫疾病、哮喘、呼吸系统疾病以及器官移植管理等应用方向。关于更细化的适用场景说明,源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 Web 服务器 http://webs.iiitd.edu.in/raghava/immunospdb/ 访问该数据库,也可通过 GitHub 仓库 https://github.com/Manish-IIITD-repository/ImmunoSPdb 获取相关内容。关于具体的检索方式、下载格式与接口调用方法,源站未提供。

【质量与限制】

该数据库为手工审编、收录经实验验证的免疫抑制肽,具备人工审编这一质量保障特征。关于数据完整性、覆盖范围、潜在偏差以及使用限制等进一步说明,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用信息为:Usmani, S. S., Agrawal, P., Sehgal, M., Patel, P. K., & Raghava, G. P. S. (2019). ImmunoSPdb: an archive of immunosuppressive peptides. Database, 2019, baz012. https://doi.org/10.1093/database/baz012。许可方式为 MIT License。

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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.20094987

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 64.9 KB。

数据说明

欢迎查阅 ImmunoSPdb 的官方文档,这是一个全面、经人工审编的数据库,收录了经实验验证的免疫抑制肽。免疫抑制肽对于降低免疫系统效能至关重要,并具有广泛的治疗应用,尤其是在治疗自身免疫性疾病、哮喘以及管理器官移植方面。网络服务器:http://webs.iiitd.edu.in/raghava/immunospdb/ 引用信息 Usmani, S. S., Agrawal, P., Sehgal, M., Patel, P. K., & Raghava, G. P. S. (2019). ImmunoSPdb: an archive of immunosuppressive peptides. Database, 2019, baz012. https://doi.org/10.1093/database/baz012 GitHub:-https://github.com/Manish-IIITD-repository/ImmunoSPdb 关于本平台 ImmunoSPdb 的开发旨在为探索能够调节免疫反应的肽的研究人员提供一个集中化资源。传统免疫抑制药物通常具有全身性副作用,而基于肽的疗法则提供了一种更具靶向性的方法。ImmunoSPdb 将分散的实验数据汇编为结构化格式,以加速新型免疫抑制先导化合物的发现与设计。

数据库统计 肽条目:包含约500条经实验验证的免疫抑制肽。数据来源:信息精心汇编自79篇研究文章。物种多样性:包括针对不同生物体的各种免疫细胞(如T细胞、B细胞、巨噬细胞)测试的肽。关键特性 搜索与浏览模块 简单搜索:基于肽名称、序列或来源的快速关键词搜索。高级搜索:使用逻辑运算符(AND/OR)在多个字段(如检测类型、靶细胞和抑制水平)中进行复杂查询。浏览:按特定类别探索数据库,如肽的性质(天然与合成)或所进行的免疫检测。全面注释 功能数据:关于免疫抑制活性的详细信息,包括抑制百分比

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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