致死性哮喘与非哮喘供体气道平滑肌转录组对糖皮质激素的反应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE94335

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

哮喘是一种慢性炎症性呼吸系统疾病，影响全球超过3亿人。部分哮喘患者对常规治疗控制不佳，并经历更多危及生命的急性加重。虽然重症难治性患者构成一个异质性群体，但大多数患者共有的一个特征包括糖皮质激素不敏感。我们试图表征致死性哮喘与非哮喘供者气道平滑肌转录组对糖皮质激素反应的差异。采用RNA-Seq测量9例致死性哮喘供者与8例非哮喘供者之间气道平滑肌转录本表达差异。每位供者的细胞用布地奈德或溶媒对照处理。采用Illumina TruSeq方法制备Poly(A)选择的RNA-Seq文库。使用Illumina HiSeq 2500仪器生成125碱基对双端读长。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。