儿童哮喘伴或不伴肥胖的CD4+ T细胞定向RNA-Seq数据集

资源简介

儿童哮喘伴或不伴肥胖的CD4+ T细胞定向RNA-Seq数据集

GSE86430 是一项针对儿童哮喘患者 CD4+ T 细胞开展的方向性 RNA 测序数据集，重点比较肥胖与非肥胖哮喘儿童 CD4+ T 细胞转录组之间的差异。该数据集由 Rastogi，Deepa 提交，来源为 NCBI，本站归类于呼吸系统疾病 / 哮喘方向。其核心目标是通过转录组层面的比较，识别在肥胖哮喘儿童 CD4+ T 细胞中差异表达的分子或通路，从而为理解哮喘与肥胖之间的交互作用提供表达谱依据。数据集以高通量测序表达谱分析为主题，包含 1 个数据文件，适合用于差异表达分析、通路富集分析等转录组研究场景。

【数据集背景】

哮喘是一种异质性较强的呼吸系统疾病，肥胖被认为是影响哮喘发生与病情表现的重要因素之一。CD4+ T 细胞在适应性免疫应答和气道炎症调控中具有重要作用，因此比较肥胖与非肥胖哮喘儿童 CD4+ T 细胞的转录组特征，有助于从免疫细胞层面观察肥胖对哮喘相关基因表达的影响。该数据集正是围绕这一比较目的而构建，采用方向性 RNA 测序技术对 CD4+ T 细胞进行表达谱分析，以识别在肥胖哮喘 CD4+ T 细胞中差异表达的分子或通路。

【数据内容】

数据集英文名为 GSE86430: Directional RNA-Seq on CD4+ T cells collected from children with asthma with/without obesity，源站标题与数据集英文名一致。数据内容属于表达谱分析，采用高通量测序技术，主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL16791 和 9606。数据集包含 1 个文件，文件样例为 GSE86430_series_matrix.txt.gz，格式为 GZIP 压缩包。该文件以系列矩阵形式组织表达谱信息，可用于后续的差异表达与通路相关分析。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov，作者为 Rastogi，Deepa，发布时间为 Sep 05 201。研究对象为患有哮喘的儿童，样本为 CD4+ T 细胞，并根据是否肥胖进行分组比较。源站描述指出，研究比较肥胖与正常体重哮喘儿童之间的 CD4+ T 细胞转录组，以识别在肥胖哮喘 CD4+ T 细胞中差异表达的分子或通路。除上述信息外，样本采集地点、采集流程、测序平台运行细节等源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于哮喘与肥胖交互作用的转录组分析，支持差异表达分析和通路富集研究。研究者可以围绕肥胖与非肥胖哮喘儿童 CD4+ T 细胞的表达谱差异，筛选差异表达分子并探索相关生物学通路。此外，该数据也适合作为呼吸系统疾病尤其是哮喘相关免疫转录组研究的辅助数据，用于比较不同体重状态下 CD4+ T 细胞的表达特征。具体分析设计应结合数据实际内容进行。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE86430_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。由于数据集仅包含 1 个系列矩阵文件，使用前应检查文件完整性及样本分组信息是否清晰，以便正确开展差异表达与通路富集分析。源站未提供更详细的分析流程或代码说明。

【质量与限制】

该数据集文件数量为 1，主要以系列矩阵形式提供，源站未提供原始测序读段、详细质控指标或批次信息。样本量、测序深度、重复设置等关键质量信息源站未提供，因此在使用时需自行评估数据适用性。此外，发布时间显示为 Sep 05 201，年份信息不完整，引用时需注意核对。数据集仅覆盖 CD4+ T 细胞转录组，结论不宜直接推广至其他细胞类型或组织。

【引用与许可】

数据集作者为 Rastogi，Deepa，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。引用时应注明数据集编号 GSE86430 及源站信息。许可条款、使用限制及具体引用格式源站未提供，使用前应查阅源站相关说明。