调控ORMDL3表达的遗传变异决定儿童哮喘易感性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE8052

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

哮喘由遗传和环境因素共同导致，但人们对这些因素的理解尚不充分。我们在家族和病例对照样本中发现，17q21染色体上的多个标记与儿童期发病的哮喘存在强烈且可重复的关联，合并P < 10^-12。在独立验证研究中，17q21位点与儿童哮喘诊断在德国儿童队列的2,320名受试者中显示出强烈关联（P = 0.0003），并在英国1958年出生队列的3,301名受试者中同样显示出关联（P = 0.0005）。我们系统评估了17q21位点标记与哮喘家族样本中儿童EBV转化类淋巴母细胞系内基因转录水平之间的关系，该样本来自我们关联研究所用的同一人群。与儿童哮喘相关的SNP在顺式作用下与ORMDL3的转录水平持续且强烈相关（P < 10^-22）。ORMDL3属于一个编码锚定于内质网的跨膜蛋白的基因家族。结果表明，调控ORMDL3表达的遗传变异是儿童哮喘易感性的决定因素。关键词：关联研究，全局基因表达，哮喘，ORMDL3

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。