细胞特异性MyD88敲除小鼠肺cDCs在OVA/标准鞭毛蛋白致敏0h和6h的分选芯片表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE79581

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

过敏性哮喘是一种以嗜酸性粒细胞和中性粒细胞炎症为特征的气道慢性疾病。MYD88是TLR及IL-1家族成员信号传导的衔接分子，在过敏性哮喘动物模型中，经气道致敏需要MYD88参与。我们分别构建了气道上皮细胞（ECs）或树突状细胞（DCs）条件性缺失Myd88的突变小鼠，以明确Myd88在这两类细胞中表达的各自贡献。为在体内研究ECs向常规（c）DCs的交互作用，我们从WT MyD88 fx/fx、SPC cre+ MyD88 fx/fx（EC-MYD88 KO）、CD11c cre+ MyD88 fx/fx（DC-MYD88 KO）及完全MyD88 KO小鼠中，分选基线状态或经气道体内过敏性致敏6小时后的肺cDCs，并检测其转录谱。我们观察到cDCs中特异性的转录改变，既包括细胞内在因素所致，也包括ECs在体内交互作用所引起。

我们还通过ATAC-seq（关联数据集）观察了cDCs中染色质构象的表观遗传变化，以及通过Nanostring nCounter免疫学代码集分析（附加关联文件）观察到的免疫特异性全肺RNA、分选EC RNA、分选肺泡巨噬细胞RNA和分选cDC的变化。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。