循环人嗜酸性粒细胞转录组学

该数据集为GSE65239,主题为循环人嗜酸性粒细胞的转录组学,来源于ncbi.nlm.nih.gov,本站归类于呼吸系统疾病/哮喘

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL136079606
GSE65239: Transcriptomics of circulating human eosinophils

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

循环人嗜酸性粒细胞转录组学

GSE65239 是一个围绕循环人嗜酸性粒细胞转录组学构建的基因表达数据集,来源于 ncbi.nlm.nih.gov,在本站归类于呼吸系统疾病 / 哮喘方向。该数据集以微阵列表达谱为主要数据类型,旨在呈现不同条件下嗜酸性粒细胞的整体表达模式,涉及嗜酸性哮喘、嗜酸性皮肤病、寄生虫感染和肺曲霉病等情形。数据集由 Cindy、Barnig 提交,发布时间为 2019 年 1 月 23 日,包含 1 个可供下载的数据文件,样例文件名为 GSE65239_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集适合作为研究嗜酸性粒细胞在多种疾病状态下转录活动差异的公开数据资源,供呼吸系统疾病特别是哮喘相关研究参考使用。

【数据集背景】

嗜酸性粒细胞是参与过敏性与寄生虫免疫反应的重要细胞类型,其在哮喘等疾病中的状态变化常与疾病表型相关。该数据集以“循环人嗜酸性粒细胞的转录组学”为主题,关注外周血嗜酸性粒细胞在不同临床条件下的全局基因表达特征。源站描述指出,其目标是刻画嗜酸性粒细胞在嗜酸性哮喘、嗜酸性皮肤病、寄生虫感染和肺曲霉病等多种条件下的整体表达模式。这一背景使数据集具备跨病种比较的潜在价值,可用于观察同一细胞类型在不同病理环境中的表达差异。本站将其归入呼吸系统疾病 / 哮喘分类,说明其在呼吸系统疾病研究语境中具有直接的相关性。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE65239_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式的表达谱矩阵文件。主题标签显示其数据类型为 Expression profiling by array,涉及平台 GPL13607 与物种编号 9606(即人类)。从文件形态看,series matrix 通常承载样本层面的表达值矩阵及配套的样本注释信息,便于直接读取和后续分析。源站描述强调“整体表达模式”,表明数据内容侧重于全局转录谱而非单一基因指标。除上述信息外,样本数量、分组构成、具体基因数量等细节源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,作者为 Cindy、Barnig,发布时间为 2019 年 1 月 23 日。源站标题与数据集英文名一致,均为“Transcriptomics of circulating human eosinophils”。数据以微阵列表达谱形式组织,平台编号为 GPL13607,物种为人类。关于样本采集地点、采集时间跨度、伦理审批信息及具体实验流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于呼吸系统疾病与哮喘相关研究中对循环人嗜酸性粒细胞转录组特征的参考分析,也可用于跨条件比较嗜酸性粒细胞在嗜酸性哮喘、嗜酸性皮肤病、寄生虫感染和肺曲霉病等状态下的整体表达模式。由于数据以微阵列表达谱矩阵形式提供,适合用于差异表达探索、样本层面表达模式核对以及与其他人类表达谱数据的对照研究。具体分析设计应结合样本注释信息确定,源站未提供更细化的适用建议。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE65239_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段结构与编码方式,确认样本标识、表达值列与注释信息对应无误后,再批量接入完整数据。由于文件为系列矩阵形式,读取后应检查行列表头与缺失值情况,确保后续分析建立在正确的数据解析基础上。源站未提供额外的预处理步骤或分析脚本。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件,数据规模与样本构成的具体信息源站未提供。平台为 GPL13607,物种为人类,主题标签明确为微阵列表达谱。由于缺少样本量、分组重复数、质控指标等细节,使用前应自行核对数据完整性与注释一致性。源站未提供关于数据质量评估、批次效应或标准化处理的说明,相关判断需依据实际文件内容进行。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Cindy、Barnig,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,发布时间为 2019 年 1 月 23 日。关于引用格式、许可条款与使用限制,源站未提供,使用时应遵循来源站的相关政策与通用学术规范。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE65239

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Global expression pattern in eosinophils in various conditions such as eosinophilic asthma, hypereosinophilic dermatological diseases, parasitosis and pulmonary aspergillosis.

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