GSE56396：气道转录组无创分析区分哮喘临床表型
该数据集来自 NCBI GEO，聚焦呼吸系统疾病中的哮喘，采用 Affymetrix HuGene ST 1.0 芯片检测受试者诱导痰中的基因表达，并通过无监督聚类识别哮喘转录组内型（TEA），再比较不同聚类间的临床特征
基本信息
资源简介
GSE56396：气道转录组无创分析区分哮喘临床表型
Non-invasive Analysis of the Airway Transcriptome Discriminates Clinical Phenotypes of Asthma
该数据集来自 NCBI GEO，聚焦呼吸系统疾病中的哮喘，采用 Affymetrix HuGene ST 1.0 芯片检测受试者诱导痰中的基因表达，并通过无监督聚类识别哮喘转录组内型（TEA），再比较不同聚类间的临床特征。数据含 1 个文件（GSE56396_series_matrix.txt.gz），可用于探索气道转录组与哮喘临床表型之间的关联，并支持基于表达谱的哮喘分型研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Apr 01 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：评估气道转录组可能揭示与哮喘临床表型相关的基因表达模式。为定义哮喘的转录组内型（TEA），我们分析了诱导痰中与疾病表型相关的基因表达。使用 Affymetrix HuGene ST 1.0 微阵列测量哮喘受试者痰液中的基因表达。对基因进行无监督聚类分析以识别 TEA 聚类。比较了临床特征。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL6244、9606。本站分类：呼吸系统疾病/哮喘。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE56396
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 08 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE56396
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
气道转录组的评估可能揭示与哮喘临床表型相关的基因表达模式。为了定义哮喘的转录组内型（TEA），我们分析了诱导痰中与疾病表型相关的基因表达。使用Affymetrix HuGene ST 1.0微阵列检测哮喘受试者痰液中的基因表达。通过无监督聚类分析对基因进行识别，确定了TEA聚类。比较了临床特征。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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