转录调节因子IκBζ对ILC2效应功能至关重要 [ATAC-Seq]
该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE346838,聚焦转录调节因子IκBζ在2型固有淋巴细胞(ILC2)效应功能中的作用,采用ATAC-Seq技术进行基因组结合/占据谱分析
![GSE346838: The transcriptional regulator IκBζ is essential for ILC2 effector functions [ATAC-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/144945.jpg)
基本信息
资源简介
转录调节因子IκBζ对ILC2效应功能至关重要 [ATAC-Seq]
The transcriptional regulator IκBζ is essential for ILC2 effector functions [ATAC-Seq]
该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE346838,聚焦转录调节因子IκBζ在2型固有淋巴细胞(ILC2)效应功能中的作用,采用ATAC-Seq技术进行基因组结合/占据谱分析。数据覆盖小鼠(10090)ILC2在稳态及IL-33或IL-25刺激下的染色质可及性变化,可用于研究IκBζ如何调控效应细胞因子基因座的染色质开放状态及转录许可,进而影响蠕虫感染和哮喘模型中的免疫应答(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 10 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):2型固有淋巴细胞(ILC2)是确保组织稳态并通过分泌2型细胞因子参与抗蠕虫免疫应答的哨兵细胞。本研究表明,IκBζ——IκB家族的非典型成员——控制ILC2的基础IL-5产生,并调控其在蠕虫感染和哮喘中的效应程序。外周ILC2在稳态下表达IκBζ,且在IL-33或IL-25刺激后以NF-κB和STAT3/5依赖的方式进一步诱导。激活后,IκBζ优化效应细胞因子基因座调控元件的染色质可及性,从而许可转录。由于ILC2的2型细胞因子分泌减少和增殖能力受损,IκBζ缺陷ILC2小鼠表现出对钩虫Nippostrongylus brasiliensis清除延迟以及木瓜蛋白酶诱导的气道炎症减轻。综上所述,我们的研究强调了t
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL34290、10090。本站分类:呼吸系统疾病/哮喘。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE346838
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 12 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE346838
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
2型固有淋巴细胞(ILC2)是保障组织稳态的哨兵细胞,并通过分泌2型细胞因子参与抗蠕虫免疫应答。本研究表明,IκBζ——IκB家族中的一种非典型成员——调控ILC2的基础IL-5产生,并在蠕虫感染和哮喘过程中主导其效应程序。在稳态条件下,外周ILC2表达IκBζ,而在IL-33或IL-25刺激后,其表达以NF-κB和STAT3/5依赖的方式进一步上调。活化后,IκBζ优化效应细胞因子基因座调控元件的染色质可及性,从而许可转录。由于ILC2的2型细胞因子分泌减少且增殖能力受损,IκBζ缺陷型ILC2小鼠对巴西钩虫(Nippostrongylus brasiliensis)的清除延迟,木瓜蛋白酶诱导的气道炎症也减轻。综上所述,本研究凸显了IκBζ在健康和疾病状态下不同组织中协调ILC2效应程序的核心作用。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




