GSE338526：IL-9R/Arg1通路促进人气道巨噬细胞多胺代谢

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE338526

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为了解CD43-/+巨噬细胞在过敏性炎症背景下转录特征的变化，我们采用流式分选获得的健康对照和哮喘患者的人BAL巨噬细胞中的CD43-和CD43+细胞进行了bulk RNA测序。主成分分析（PCA）显示，哮喘患者的CD43-巨噬细胞样本与健康对照患者的CD43-巨噬细胞明显不同，且两者均与聚集在一起的CD43+巨噬细胞群体分离。我们还观察到哮喘期间CD43-巨噬细胞特有的深刻转录反应，而将哮喘样本与对照相比时，CD43+巨噬细胞中仅有小部分基因发生改变。与健康对照样本相比，哮喘样本对上调基因的影响更为广泛（图s5A）。哮喘组表现出若干关键免疫和炎症基因的强烈上调——包括CCL18、CCL23、CCL24和CXCL9等趋化因子，以及MARCKS和C5AR1——同时伴有CEBPB、MAF和MAFB等转录因子的上调。

相反，对照组呈现出一种独特的特征，表现为少数基因的上调，其中最显著的是IKBKG和TLR7，这凸显了健康对照组与哮喘状态之间在巨噬细胞活化和信号传导方面存在明显的分子差异。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。