GSE336792：干细胞因子248塑造ILC2转录程序并促进过敏性哮喘黏膜炎症

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE336792

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

干细胞因子（SCF），也称为Kit配体，是一种多效性细胞因子，通过c-Kit受体传递信号，调控细胞的发育、存活和增殖。尽管SCF经典上因其在造血和肥大细胞生物学中的重要作用而被认识，但c-Kit也表达于固有淋巴样细胞前体（ILCp）和成熟固有淋巴样细胞（ILCs）的亚群，提示其具有更广泛的免疫调节功能。2型固有淋巴样细胞（ILC2s）是2型气道炎症的关键介质，并在过敏反应中作为2型细胞因子的重要来源。我们此前已证明，在慢性过敏性炎症小鼠的肺部，促炎性SCF248亚型的表达增加，同时也有报道称哮喘患者中可溶性SCF水平升高。在本研究中，我们进一步观察到，在过敏性炎症期间，骨髓中SCF248表达上调，提示SCF248可能同时参与过敏免疫反应的局部和全身性调控。

为明确SCF/c-Kit信号在ILC2生物学中的作用，我们首先对SCF缺陷型ILC2进行了转录谱分析，结果显示与细胞因子信号传导、活化和效应功能相关的基因表达降低，包括Il4、Stat5b以及PI3K-AKT通路组分，这与炎症反应性受损相一致。在机制上，促炎细胞因子和2型细胞因子在体外诱导间充质细胞中SCF248的表达。为明确其功能影响，我们将ILC祖细胞培养于SCF248表达上调的OP9-DL1基质细胞上，结果ILC2相关标志物及成熟程序的表达增加，支持SCF248在增强ILC2成熟与活化中的作用。利用他莫昔芬诱导的全身性SCF缺陷小鼠（SCFfl/fl；UBC-CreERT2）在链格孢属过敏性气道炎症模型中进行体内验证，结果表明SC

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。