GSE331548：Rab44缺失通过调节免疫反应和嗜酸性粒细胞功能减轻卵清蛋白诱导的过敏性气道炎症

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE331548

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数据说明

引言：哮喘是一种慢性气道炎症性疾病，伴有黏液分泌过多、气道重塑和支气管高反应性。然而，膜运输分子促进哮喘发展的机制仍不清楚。在本研究中，我们在模拟人类哮喘的过敏性气道炎症小鼠模型中研究了Rab44的作用，因为我们此前已鉴定出Rab44并正在探索其功能。方法：在经卵清蛋白（OVA）致敏的Rab44基因敲除（KO）小鼠和野生型（WT）小鼠中诱导实验性过敏性气道炎症。进行了组织病理学分析、RNA测序（RNA-seq）分析、脱颗粒实验、黏附和迁移实验，以及黏附和趋化因子受体的流式细胞术分析。结果：与WT小鼠相比，Rab44-KO小鼠表现出OVA诱导的过敏性气道炎症受损。RNA-seq分析显示，Rab44缺陷影响了OVA诱导小鼠肺中参与免疫和炎症反应的若干信号通路。

此外，与WT小鼠相比，KO小鼠中细胞因子的mRNA水平以及浸润支气管肺泡灌洗液的淋巴细胞、单核细胞和嗜酸性粒细胞数量均降低。在来源于骨髓细胞的嗜酸性粒细胞培养物中，Rab44-KO嗜酸性粒细胞表现出异常分化和嗜酸性粒细胞过氧化物酶释放受损，但主要碱性蛋白未受影响。Rab44-KO嗜酸性粒细胞表现出细胞黏附和趋化性降低。与这些发现一致，Rab44-KO嗜酸性粒细胞表面黏附受体和趋化因子受体的表达受损。结论：这些结果表明，Rab44缺陷通过调节免疫反应和嗜酸性粒细胞功能，减轻了OVA诱导的过敏性气道炎症。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。