肺与脂肪组织间细胞通讯数据集
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,标题为肺与脂肪组织间细胞通讯,属于呼吸系统疾病/哮喘分类。研究者利用微阵列基因表达分析,对大鼠哮喘模型肺部与脂肪组织的 mRNA 水平进行表达谱检测,共包含 1 个文件(GSE315152_series_matrix.txt.gz)

基本信息
资源简介
肺与脂肪组织间细胞通讯数据集
GSE315152 是一个围绕肺与脂肪组织间细胞通讯开展的研究数据集,标题为“Intercellular communication between the lung and adipose tissue”,归属于呼吸系统疾病 / 哮喘分类,来源于 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集通过微阵列基因表达分析,对大鼠哮喘模型肺部与脂肪组织的 mRNA 水平进行表达谱检测,旨在从转录层面观察这两个组织在哮喘状态下的基因表达情况。数据集共包含 1 个文件,即 GSE315152_series_matrix.txt.gz,作者为 Wojciech、Langwinski,发布时间为 Dec 29 202,主题标签涉及 Expression profiling by array、GPL22740 和 10116。整体而言,该数据集为研究哮喘模型中肺与脂肪组织之间的相互联系提供了可下载的表达谱数据资源。
【数据集背景】
该数据集聚焦于呼吸系统疾病中的哮喘,研究主题为肺与脂肪组织之间的细胞通讯。源站描述指出,研究者使用微阵列基因表达分析,对大鼠哮喘模型肺部与脂肪组织的 mRNA 水平进行表达谱检测。这一背景说明数据集关注的是哮喘状态下肺部与脂肪组织在基因表达层面的表现,适合围绕组织间通讯这一主题进行数据层面的观察与分析。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE315152_series_matrix.txt.gz。该文件以 GZIP 压缩包形式提供,内容为微阵列基因表达分析所得的系列矩阵数据。主题标签包括 Expression profiling by array、GPL22740 和 10116,分别对应表达谱检测方式、平台标识与物种标识。数据覆盖肺部与脂肪组织两个组织来源,检测对象为 mRNA 水平。除上述信息外,源站未提供更细化的样本数量、分组设计或基因数量等说明。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“Intercellular communication between the lung and adipose tissue”。研究者采用微阵列基因表达分析技术,对大鼠哮喘模型的肺部与脂肪组织进行 mRNA 水平检测。数据集作者为 Wojciech、Langwinski,发布时间为 Dec 29 202。数据以系列矩阵文件的形式对外提供,用户可通过下载 GSE315152_series_matrix.txt.gz 获取。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病尤其是哮喘相关的研究场景,可用于观察哮喘模型中肺部与脂肪组织的 mRNA 表达谱,支持围绕肺与脂肪组织间细胞通讯这一主题开展表达层面的探索。由于数据同时涉及肺部与脂肪组织,也适合用于比较两个组织在哮喘模型中的表达特征。具体分析目标需结合用户自身研究设计确定,源站未提供针对特定分析场景的说明。
【使用方法】
使用该数据集时,首先下载数据文件 GSE315152_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,读取前需按 GZIP 格式进行解压或直接以相应方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。源站未提供额外的使用步骤或分析脚本说明。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件,源站未提供样本量、重复数、质控指标或缺失值处理等质量相关信息。发布时间标注为 Dec 29 202,年份信息不完整。除源站描述与主题标签外,源站未提供更详细的技术参数与实验设计说明,使用时应结合数据文件本身进行核对。
【引用与许可】
数据集作者为 Wojciech、Langwinski,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站未提供具体的引用格式与许可条款信息,使用或再分发前应前往源站页面核实相关要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE315152
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们采用微阵列基因表达分析技术,对大鼠哮喘模型中肺部和脂肪组织的mRNA水平进行了 profiling。
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