CBX7作为甲基化依赖性基因转录诱导因子及淋巴样细胞胞质信号调控因子的研究数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299942

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

CBX7是一种染色质重塑因子，通常作为基因抑制因子发挥作用。我们意外地发现，CBX7能够稳固地形成依赖甲基化的转录复合物和信号复合物，通过结合细胞因子基因启动子直接诱导基因转录。CBX7转位至细胞质，与c-Raf、MEK1/2和CK2-α形成依赖甲基化的信号复合物，以产生并维持ERK1/2信号传导。CBX7是一种过敏原诱导型基因。通过遗传学和药理学干预手段，我们证实了CBX7在小鼠和哮喘患者T细胞及ILC2s产生细胞因子方面发挥关键作用，并在多种小鼠哮喘模型中诱导过敏性炎症。RNA测序显示，CBX7-/- T细胞中出现大规模基因转录的缺失和增加。下调最显著的信号通路包括细胞因子-细胞因子受体相互作用、哮喘以及辅助性T细胞分化。CBX7对转录激活复合物的诱导以及对ERK1/2信号体的甲基化具有淋巴细胞的特异性，因为在上皮细胞中不存在这些现象。

我们的研究确立了CBX7生成的甲基化依赖性信号复合物调控炎症的新范式。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。