GSE299878：RPS4Y1在炎症与纤维化过程中的新型调控作用

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299878

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数据说明

哮喘是一种慢性炎症性呼吸系统疾病，其在发病率和严重程度上表现出明显的性别二态性，尽管导致这些差异的机制仍未完全阐明。RPS4X和RPS4Y1是分别位于X染色体和Y染色体上的基因，编码核糖体亚基，此前已被认为与炎症、气道重塑及哮喘药物疗效相关。尤其是RPS4Y1，在疾病背景下的研究尚不充分，对该基因所调控的分子机制和通路的探讨甚少。核糖体是至关重要的细胞机器，负责将mRNA翻译为多肽，进而生成蛋白质。核糖体组分的失衡或功能障碍可能导致蛋白质功能异常。我们利用CRISPR-Cas9技术构建了RPS4Y1和RPS4X的敲除细胞模型，在哮喘相关过程——炎症和纤维化——的背景下表征了RPS4Y1的功能。未能获得可存活的RPS4X敲除细胞。我们揭示了新的分子机制，例如含有RPS4Y1的核糖体对IL6和tenascin-C mRNA的特异性翻译。

此外，以RPS4Y1为中心的基因特征与成年男性哮喘患者的临床肺功能测量指标特异性相关。这些发现有助于当前对哮喘性别差异的理解，因为女性不产生RPS4Y1蛋白。因此，RPS4Y1的病理相关功能可能促成了哮喘易感性和进展中复杂的性别二态性模式。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。