接受生物制剂治疗的T2-high重症哮喘患者转录组学：抗IgE、抗IL-5与抗IL-5R靶向治疗比较

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298740

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

背景：生物制剂疗法已改变重度哮喘的管理格局，尤其是对T2高型哮喘。本研究旨在探讨生物制剂治疗后的血液蛋白质组学和转录组学变化。方法：开展了一项前瞻性研究，纳入35例接受美泊利珠单抗（n=9）、贝那利珠单抗（n=14）或奥马珠单抗（n=12）治疗的重度T2高型哮喘患者。评估分别在基线时以及治疗16周（奥马珠单抗）或24周（美泊利珠单抗、贝那利珠单抗）后进行。采集血液样本。通过Illumina TruSeq RNA Prep分析基因表达，并在Illumina NovaSeq-6000平台上进行RNA测序。结果：RNA-seq分析显示，美泊利珠单抗和贝那利珠单抗共有86个下调基因，主要与嗜酸性粒细胞、嗜碱性粒细胞及嘌呤能受体信号通路相关。此外，有证据表明涉及抗病毒免疫的基因调控。然而，贝那利珠单抗（114个基因）和美泊利珠单抗（68个基因）观察到了特异性基因调节。奥马珠单抗治疗后的变化极小，仅有三个显著下调的基因。

结论：尽管奥马珠单抗对基因表达的可量化影响极小，但美泊利单抗和贝那利珠单抗——尽管表现出不同的表达谱——均诱导了与嗜酸性粒细胞和嗜碱性粒细胞生物学及嘌呤能信号通路相关基因的下调，同时上调了参与先天抗病毒免疫的基因。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。