特应性哮喘降低鼻黏膜鞘脂（GSE297032）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE297032

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数据说明

17q21哮喘风险基因座的遗传变异调控gasdermin B（GSDMB）和ORMDL3的表达，影响炎症反应和鞘脂代谢。虽然已知哮喘相关的17q21变异会影响免疫细胞和气道平滑肌细胞中ORMDL3的表达，但其在气道上皮鞘脂代谢中的作用仍不清楚。我们研究了哮喘和17q21遗传变异是否影响上呼吸道鞘脂组成，以及免疫细胞与上皮细胞如何参与这一过程。我们分析了哮喘患儿和非哮喘患儿鼻腔液体及血液中的鞘脂谱。我们还检测了rs7216389 C/C和T/T（哮喘风险）基因型纯合的健康成人鼻上皮细胞和PBMC中的基因表达和鞘脂组成。特应性哮喘患儿鼻腔液体中鞘脂水平较低，包括鞘氨醇、二氢神经酰胺和神经酰胺，且不受皮质类固醇使用或过敏性鼻炎的影响。哮喘还与血浆鞘脂升高和血细胞鞘脂降低相关，后者与鼻腔液体中的模式一致。

在PBMCs中，T等位基因增加ORMDL3表达，抑制从头鞘脂合成。然而，在鼻上皮细胞中，T等位基因主要增加GSDMB，对鞘脂代谢无影响。这些发现确立了鼻液鞘脂谱分析作为特应性哮喘潜在标志物的地位，并提供了17q21遗传变异具有细胞类型特异性效应的证据。虽然ORMDL3介导的鞘脂抑制发生在PBMCs而非气道上皮细胞中，但其全身效应可能有助于降低哮喘患者下气道的鞘脂水平。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。