GSE289352：学龄儿童浆细胞样树突状细胞I型干扰素应答降低与哮喘相关

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE289352

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数据说明

过敏性致敏和对病毒感染反应能力降低可能导致幼儿病毒诱发性喘息和哮喘的发生。浆细胞样树突状细胞（pDC）是产生I型干扰素（IFN-I）的稀有免疫细胞，在协调抗病毒免疫反应中发挥关键作用。为进一步评估pDC在哮喘儿童中的功能，我们对早期生命肺功能（ELLF）队列中71名7岁儿童进行了研究。作为ELLF研究的一部分，对参与者进行了特应性致敏、病毒感染史和肺功能检测的表征。采用体外实验评估pDC在存在或不存在抗IgE的情况下对TLR7/8激动剂的反应。利用流式细胞术、多重细胞因子检测和分离pDC的转录分析对反应进行评估。pDC反应在个体间差异很大，刺激后以IFN-I应答的个体与仅以TNF应答的个体相比，哮喘比例较低。仅TNF应答与特应性增加及IFN相关基因上调减少相关。

抗IgE刺激降低了pDC活化，且这种降低与IgE受体（FceR1）的基线表达相关。还观察到以TPM2、LILRA4和CLEC4C等基因为中心的基因模块出现下调。总之，这些发现表明pDC反应具有变异性，与哮喘相关，并似乎受到环境刺激的影响。因此，这种反应似乎是儿童哮喘病理的一个重要方面。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。