Brg1对ILC2的调控研究数据集

该数据集来自NCBI,标题为Regulation of ILC2s by Brg1,聚焦呼吸系统疾病中的哮喘。源站描述指出染色质重塑因子Brg1在IL-33诱导的ILC2中上调,与开放染色质区域增加相关,并在哮喘患者ILC2中上调;敲除Brg1可限制ILC2扩增并改善肺部炎症

geo
浏览 10
基因组分类GPL2424710090
GSE279674: Regulation of ILC2s by Brg1

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

Brg1对ILC2的调控研究数据集

Regulation of ILC2s by Brg1

该数据集来自NCBI,标题为Regulation of ILC2s by Brg1,聚焦呼吸系统疾病中的哮喘。数据包含1个文件GSE279674_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing,物种为小鼠(10090),平台GPL24247。源站描述指出染色质重塑因子Brg1在IL-33诱导的ILC2中上调,与开放染色质区域增加相关,并在哮喘患者ILC2中上调;敲除Brg1可限制ILC2扩增并改善肺部炎症。该数据可用于研究Brg1通过染色质景观调控ILC2代谢与记忆的机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 17 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):染色质状态随效应性和记忆性2型先天淋巴样细胞(ILC2)应答而波动。这种复杂的协调如何影响过敏性肺部炎症仍不清楚。在此,我们报告在木瓜蛋白酶诱导的肺部炎症过程中,染色质重塑因子Brg1的表达在ILC2中由IL-33上调,伴随更多开放染色质区域可及性增加。Brg1表达在哮喘患者的ILC2中也上调。敲除Brg1可限制ILC2扩增并改善急性和警报素再攻击的继发性肺部炎症。机制上,Brg1印记有利于有氧糖酵解的染色质景观,该代谢过程在效应性和记忆性ILC2中增强,以促进ILC2扩增。特别是,Brg1增强的Hif1a增强子可及性是记忆性ILC2中从效应性ILC2继承的持续表观遗传特征。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:呼吸系统疾病/哮喘。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE279674

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 23 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE279674

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

染色质状态随效应性和记忆性2型固有淋巴细胞(ILC2)应答而波动。这种复杂的协调如何影响过敏性肺部炎症仍不清楚。在此,我们报道,在木瓜蛋白酶诱导的肺部炎症过程中,IL-33上调ILC2中染色质重塑因子Brg1的表达,并伴随更多染色质开放区域可及性增加。Brg1表达在哮喘患者的ILC2中也上调。敲除Brg1可限制ILC2扩增,并改善急性和警报素再攻击的继发性肺部炎症。机制上,Brg1塑造有利于有氧糖酵解的染色质景观,该代谢过程在效应性和记忆性ILC2中增强,以促进ILC2扩增。特别是,Brg1增强的Hif1a增强子可及性是记忆性ILC2中从效应性ILC2继承的持续表观遗传特征,且Hif1a增强效应性和记忆性ILC2应答。在急性期药物抑制Brg1而非地塞米松治疗,足以减轻继发性肺部炎症,突显Brg1作为有前景的治疗靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案