单次过敏原激发后野生型与Trim33缺陷AMs的基因表达谱
该数据集来自NCBI GEO，包含野生型与Trim33缺陷型肺泡巨噬细胞（AMs）在单次过敏原激发后的基因表达谱，采用高通量测序技术，物种为小鼠（10090），平台为GPL23479，共1个文件
基本信息
资源简介
单次过敏原激发后野生型与Trim33缺陷AMs的基因表达谱
GSE277957 数据集来自 NCBI GEO，主题为野生型与 Trim33 缺陷型肺泡巨噬细胞（AMs）在单次过敏原激发后的基因表达谱。该数据集归类于呼吸系统疾病 / 哮喘方向，采用高通量测序技术进行表达谱分析，物种为小鼠，测序平台为 GPL23479，共包含 1 个数据文件，样例文件为 GSE277957_series_matrix.txt.gz。数据集由 Jiaoyan Lv 提交，发布时间为 Sep 24 202。整体来看，该数据集围绕 TRIM33 在肺泡巨噬细胞活化状态调控中的作用展开，为研究过敏性哮喘条件下肺泡巨噬细胞的功能变化提供了转录组层面的表达数据。
【数据集背景】
Tripartite motif-containing protein 33（TRIM33）是一种多功能蛋白，参与多种生理与病理过程。然而，其在调节肺泡巨噬细胞（AMs）功能方面的作用，特别是在过敏性哮喘条件下是否发挥作用，此前尚未被探索。该数据集通过对野生型与 Trim33 缺陷型 AMs 在单次过敏原激发后进行基因表达谱分析，揭示了 TRIM33 在调控单次过敏原激发后 AMs 活化状态中的关键作用。数据集所属分类为呼吸系统疾病 / 哮喘，与过敏性疾病背景下巨噬细胞功能研究密切相关。
【数据内容】
该数据集包含野生型与 Trim33 缺陷型肺泡巨噬细胞在单次过敏原激发后的基因表达谱数据，采用表达谱分析（高通量测序）方式产生。数据集共包含 1 个文件，样例文件名为 GSE277957_series_matrix.txt.gz，格式为 GZIP 压缩包。主题标签涉及 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL23479 与 10090，其中 10090 对应小鼠物种，GPL23479 为所用测序平台。数据内容聚焦于比较野生型与 Trim33 缺陷型 AMs 在过敏原激发后的转录组差异，用以反映 TRIM33 对 AMs 活化状态的调控作用。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov（NCBI GEO），源站标题为“Gene expression profiling of wild type and Trim33-deficient AMs after single allergen challenge”。数据由 Jiaoyan Lv 提交，发布时间为 Sep 24 202。物种为小鼠（10090），测序平台为 GPL23479，数据组织为单个系列矩阵文件。除上述来源信息外，样本采集的具体地点、时间、伦理审批等信息源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病特别是哮喘相关研究，可用于探讨过敏原激发后肺泡巨噬细胞活化状态的转录组变化，以及 TRIM33 缺失对 AMs 基因表达谱的影响。适合用于比较野生型与 Trim33 缺陷型 AMs 之间的表达差异分析、候选基因与通路层面的探索性研究，以及作为过敏性哮喘中巨噬细胞功能研究的参考表达谱数据。具体实验设计细节与分组信息源站未提供。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE277957_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。由于数据集仅包含 1 个系列矩阵文件，使用时应先了解文件内的样本组织与注释信息，再开展表达谱比较分析。分析流程、标准化方法与统计方案源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件，数据规模与样本数量信息源站未提供。数据来源于 NCBI GEO，平台为 GPL23479，物种为小鼠。关于测序深度、重复数、质控指标、批次信息等质量相关内容源站未提供。使用时应注意数据集仅覆盖单次过敏原激发条件下的表达谱，结论外推需谨慎。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Jiaoyan Lv，发布时间为 Sep 24 202，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。数据许可方式与具体引用格式源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE277957
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
含三联基序蛋白33（TRIM33）是一种多功能蛋白，参与多种生理和病理过程。然而，其在调节肺泡巨噬细胞（AMs）功能中的作用，尤其是在过敏性哮喘条件下的作用，尚未被探索。对野生型和Trim33缺陷型AMs的基因表达谱分析揭示了TRIM33在单次过敏原激发后调节AMs激活状态中的关键作用。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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