重度哮喘、轻度哮喘与健康对照的表达数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE27011

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：约5%的哮喘患儿尽管接受了广泛治疗，仍存在慢性症状和/或严重急性发作。严重治疗抵抗性儿童哮喘的病因尚不清楚。目的：明确严重治疗抵抗性哮喘与控制良好哮喘及健康对照者之间的全局基因表达模式。方法：从一项包含广泛临床和免疫学特征的瑞典全国性研究中识别出严重治疗抵抗性哮喘（SA，n=20）和控制良好哮喘（CA，n=20）患儿。此外，招募健康对照者（Ctrl，n=19）。分离白细胞，并使用Affymetrix Human Gene ST 1.0芯片对全局转录组谱进行表征。结果：在CA vs. Ctrl、SA vs. CA或SA vs. Ctrl对比中的一个或多个对比中，有1378个基因存在差异表达。大量基因能够独特地将SA组与CA组（n=351个基因）和Ctrl组（n=315个基因）区分开来，而将CA组与Ctrl组区分开来的基因较少（n=149个）。与CA或Ctrl相比，SA中有多个非编码RNA被发现上调。

三条显著富集的KEGG通路分别为：苦味转导通路、TAS2Rs（主要在SA中上调）、自然杀伤细胞介导的细胞毒性（在CA中上调）以及N-糖基化生物合成（在SA中下调）。对1378个基因进行无监督层次聚类，可粗略区分SA、CA和Ctrl个体。结论：我们的数据表明，重度治疗抵抗性哮喘儿童与受控持续性哮喘儿童之间存在基因表达模式的差异，并提示了表征重度治疗抵抗性哮喘表型的新通路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。