EP4受体激动剂对气道上皮基因组效应数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE267218

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

有人提出，吸入型EP4受体激动剂可作为治疗哮喘的替代类支气管扩张剂，其疗效与β2肾上腺素受体激动剂相当。然而，此类药物的基因组学影响常被忽视，尽管其可能对呼吸系统健康产生潜在危害。本研究采用mRNA-seq技术，在BEAS-2B人气道上皮细胞中比较了ONO-AE1-329（一种EP4受体激动剂）与维兰特罗（一种β2肾上腺素受体激动剂）的基因组学影响。我们还通过将研究扩展至腺苷A2B受体激动剂Bay-60-6583和I-前列腺素受体激动剂taprostene，探究了不同GPCR介导的cAMP升高是否促进不同的转录特征。ONO-AE1-329和维兰特罗的最大有效浓度分别显著调控了232个和320个基因（q ≤ 0.05；≥1.5-/≤0.67倍），其中217个基因共同受调控。Spearman分析显示，这些基因表达变化具有高度秩次相关性，表明两种干预措施之间的功能重叠应相当显著。

出乎意料的是，ONO-AE1-329、维兰特罗、Bay 60-6583和曲前列环素的基因组效应也呈现出高度等级顺序相关性。这一发现提出了这样一种可能性：由任何GPCR产生的cAMP都会启动相同的转录程序。然而，相对于维兰特罗，ONO-AE1-329通常表现为部分激动剂，其效力和内在活性因转录本而异。总体而言，本研究表明，每个受ONO-AE1-329调控的基因对cAMP的敏感性不同，并由独特的受体占据-反应关系所界定。此外，如果BEAS-2B细胞中这种相对温和的基因组反应在体内得以重现，那么吸入型EP4受体激动剂可能代表一类更安全的支气管扩张剂。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。