YTHDF1-CLOCK轴通过LLPS参与过敏性气道炎症发病机制 [m6A-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE256458

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

N6-甲基腺苷（m6A）修饰已被认为与许多细胞过程和疾病相关。YTHDF1是一种促进翻译的m6A阅读蛋白，此前未被证明与过敏性气道炎症相关。在此，我们报道YTHDF1在过敏性气道上皮细胞（AECs）和哮喘患者中高表达，并影响促炎反应。CLOCK是昼夜节律钟通路的亚基，是YTHDF1的直接靶标。YTHDF1以m6A依赖的方式增强CLOCK翻译。过敏原增强YTHDF1的液-液相分离（LLPS），并驱动形成由二聚体YTHDF1和CLOCK mRNA组成的复合物，该复合物被分布到应激颗粒（SGs）中。此外，YTHDF1强烈激活NLRP3炎症小体的产生和IL-1β的分泌，导致气道炎症反应，但这些表型在删除CLOCK后被消除。这些发现表明YTHDF1是哮喘气道炎症的重要调节因子，提示其可能是过敏性气道炎症的潜在治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。