非肺气肿型慢性阻塞性肺疾病外周血单个核细胞转录组差异特征数据集 [COPD_PBMC]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE248493

标准获取流程：

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3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

基于胸部计算机断层扫描(CT)表现定义的非肺气肿型COPD，可能呈现源自骨髓(BM)的外周血单个核细胞(PBMC)的不同转录组特征。在固定性阻塞性障碍型COPD(包括气道优势表型)中，上调的差异表达基因(DEGs)主要与Th2炎症、肺血管重塑抑制以及BM来源祖细胞功能相关。气道优势表型与较轻的阻塞性损害相关。肺气肿型COPD中上调的DEGs可能与气道炎症和重塑相关，提示存在哮喘成分。XCL1、PRKCZ、TMEM102、CD200R1和AQP1水平上调与T淋巴细胞和嗜酸性粒细胞的活化相关。硫酸角质素生物合成和代谢过程的上调与远端气道免受破坏相关。ITGA3的上调可增强与细胞外基质蛋白的相互作用。COL6A1可能在肺泡VI型胶原沉积过程中增强促纤维化肥大细胞表型。

HSPG2、PDGFRB和PAK4的上调可能促进气道壁增厚。SERPINF1的上调可能解释了血管床得以更好保存的原因，而SERPINF1和ISM1的上调似乎能防止肺气肿形成。PBMCs中的这些模式可能与无肺气肿型COPD的发病机制有关。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。