吸入性过敏原诱导肺迁移性Th2细胞中IL-2与IL-10协同作用的空间微生态(空间转录组学)
源站描述显示研究利用时间、空间和单细胞转录组追踪屋尘螨(HDM)特异性T细胞,解析驱动过敏原特异性Th2细胞的分子通路,涉及IL-2空间微生态与IL-10的协同作用
![GSE245110: Spatial microniches of IL-2 synergize with IL-10 to drive lung migratory Th2 cells in response to inhaled allergen [Spatial transcriptomics]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/154759.jpg)
基本信息
资源简介
吸入性过敏原诱导肺迁移性Th2细胞中IL-2与IL-10协同作用的空间微生态(空间转录组学)
Spatial microniches of IL-2 synergize with IL-10 to drive lung migratory Th2 cells in response to inhaled allergen [Spatial transcriptomics]
该数据集来自NCBI GEO(GSE245110),包含1个文件(GSE245110_series_matrix.txt.gz),主题为空间转录组学,分类属呼吸系统疾病/哮喘。源站描述显示研究利用时间、空间和单细胞转录组追踪屋尘螨(HDM)特异性T细胞,解析驱动过敏原特异性Th2细胞的分子通路,涉及IL-2空间微生态与IL-10的协同作用。数据可用于研究哮喘相关Th2细胞分化与迁移机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Oct 11 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):引导屏障组织中Th2细胞分化的机制尚不清楚,但对过敏性哮喘的发展很重要。利用对屋尘螨(HDM)特异性T细胞的时间、空间和单细胞转录组追踪,我们描述了驱动过敏原特异性Th2细胞的分子通路。早期Blimp-1表达发生在淋巴结中一部分CD4 T细胞中,早于由过敏原特异性T细胞产生的IL-10驱动的肺迁移,但并非GATA3上调所必需。相反,IL-2通过STAT5直接抑制Bcl6和Bach2,以支持GATA3和Blimp-1上调。在淋巴结启动期间缺失Blimp-1消除了迁移至肺的Th2细胞的形成,表明早期Blimp-1促进具有迁移能力的Th2细胞群体。淋巴结中IL-2的空间微生态区分并支持这些
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Other、GPL30172、10090。本站分类:呼吸系统疾病/哮喘。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE245110
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 21 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
引导屏障组织中Th2细胞分化的机制尚不清楚,但对过敏性哮喘的发生具有重要意义。通过对屋尘螨(HDM)特异性T细胞进行时间、空间及单细胞转录组追踪,我们描述了驱动过敏原特异性Th2细胞的分子通路。早期Blimp-1表达出现在淋巴结中一部分CD4 T细胞中,发生于向肺部迁移之前,由过敏原特异性T细胞产生的IL-10驱动,但Blimp-1并非GATA3上调所必需。相反,IL-2通过STAT5直接抑制Bcl6和Bach2,从而支持GATA3和Blimp-1的上调。在淋巴结致敏阶段缺失Blimp-1会消除迁移至肺部的Th2细胞的形成,表明早期Blimp-1促进具有迁移能力的Th2细胞群体形成。淋巴结中IL-2的空间微环境对这些最早的Blimp-1+迁移性Th2细胞具有区分和支持作用,证明淋巴结定位是细胞分化的主要驱动因素。
我们的研究结果揭示了吸入性过敏原促进Th2细胞的分子途径,并确定了IL-2介导的空间微生态位以及应答T细胞由过敏原驱动的IL-10在驱动过敏性哮喘中的早期需求。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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