哥斯达黎加哮喘儿童血清miRNA测序数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE244573

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

从参与哥斯达黎加哮喘遗传学研究（GACRS）的1，134名6至14岁哮喘儿童中，对储存的外周血血清进行了小RNA测序。我们将参与者按支气管扩张剂反应性（BDR）高低四分位数进行分组，并使用DeSeq2鉴定高BDR组（N=277）与低BDR组（N=278）之间差异表达（DE）的miRNA。确定了DE miRNA的推定靶基因，并进行了通路富集分析。结果：我们鉴定出10个下调的miRNA，其miRNA计数加倍的优势比（OR）在0.37至0.76之间，以及1个在高BDR组与低BDR组之间上调的miRNA（OR=2.26）。此外，对11个DE miRNA以及两个重复验证的miR进行了功能注释。这些miR的靶基因富集于SREBPs调控的胆固醇生物合成、ESR介导的信号传导、G1/S转换、RHO GTPase循环以及TGFB家族通路信号传导。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。