屋尘螨过敏原对人上皮细胞多重转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE243680

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

过敏性哮喘是一种导致气道炎症的慢性疾病，是重要的公共卫生问题。我们的研究团队发现，台湾中部超过80%的过敏儿童对多种屋尘螨（HDMs）致敏。本研究聚焦于屋尘螨粗提物如何影响人上皮BEAS-2B细胞，以了解预防过敏性疾病的早期基本机制。因此，RNA-seq分析显示，三种 Dermatophagoides 屋尘螨过敏原在4小时处理内激活人上皮细胞中共同的Toll样受体信号通路。在此过程中，核转录因子NF-κB在过敏原刺激后30分钟内转位进入细胞核，触发IL-6和IL-8等促炎基因在4小时内的表达。此外，用特定的 Dermatophagoides microceras（Der m）过敏原处理细胞时，调控1型糖尿病信号通路的基因出现上调，介导IL-12A炎症。

此外，经Der m过敏原与地塞米松联合处理后，人上皮细胞中与纤毛功能和微管细胞骨架相关的基因集有所增加。此外，OMICs分析研究了HDMs过敏原刺激对人表皮细胞的影响。该过程旨在加深我们对HDMs过敏原所致哮喘精准医学中潜在靶点和生物活性物质背后细胞分子机制的理解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。