DEK缺陷通过抑制线粒体自噬预防屋尘螨诱导的哮喘
该数据集来自NCBI,包含1个文件,主题为DEK缺陷通过抑制线粒体自噬保护抵抗屋尘螨诱导的哮喘。研究涉及DEK在哮喘气道炎症中的作用,以及调控PINK1-Parkin介导的线粒体自噬、NLRP3炎症小体激活和细胞凋亡

基本信息
资源简介
DEK缺陷通过抑制线粒体自噬预防屋尘螨诱导的哮喘
DEK deficiency suppresses mitophagy to protect against house dust mite-induced asthma
该数据集来自NCBI,包含1个文件,主题为DEK缺陷通过抑制线粒体自噬保护抵抗屋尘螨诱导的哮喘。研究涉及DEK在哮喘气道炎症中的作用,以及调控PINK1-Parkin介导的线粒体自噬、NLRP3炎症小体激活和细胞凋亡。数据可用于分析DEK对嗜酸性粒细胞募集、线粒体碎片化及自噬体形成的影响,适用于呼吸系统疾病尤其是哮喘的机制研究与分类分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 19 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究旨在探究DEK在哮喘气道炎症中的作用和机制,以及在调控PTEN诱导的假定激酶1(PINK1)-Parkin介导的线粒体自噬、NLRP3(NOD样受体家族pyrin结构域包含3)炎症小体激活和细胞凋亡中的作用。我们发现重组DEK蛋白(rmDEK)在屋尘螨(HDM)诱导的哮喘中促进嗜酸性粒细胞募集、线粒体碎片化,以及支气管肺泡灌洗液(BALF)中外膜20(TOM20)和LC3共定位(代表自噬体)。rmDEK还减少了线粒体融合蛋白mitofusin1(MFN1)与线粒体的共定位,以及锰超氧化物歧化酶(MnSOD)的蛋白水平,增强了微管相关蛋白1轻链3(LC3)和电压依赖性阴离子通道(VDAC)的共定位(这也代表气道上皮细胞中的自噬体)。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:呼吸系统疾病/哮喘。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE243532
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 25 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
本研究旨在探究DEK在哮喘气道炎症中的作用及其机制,以及其在调控PTEN诱导假定激酶1(PINK1)-Parkin介导的线粒体自噬、NLRP3(NOD样受体家族pyrin结构域包含3)炎症小体活化和细胞凋亡中的作用。我们发现,在屋尘螨(HDM)诱导的哮喘中,重组DEK蛋白(rmDEK)促进嗜酸性粒细胞募集、线粒体碎片化,以及支气管肺泡灌洗液(BALF)中外膜20(TOM20)与LC3共定位(代表线粒体自噬体)。rmDEK还减少线粒体融合蛋白mitofusin1(MFN1)与线粒体的共定位以及锰超氧化物歧化酶(MnSOD)的蛋白水平,增强微管相关蛋白1轻链3(LC3)与电压依赖性阴离子通道(VDAC)的共定位(同样代表气道上皮细胞中的线粒体自噬体),此外,还增加动力相关蛋白1(DRP1)表达、PINK1-Parkin介导的线粒体自噬、NLRP3炎症小体活化和细胞凋亡。
在DEK基因敲除小鼠中,HDM诱导的哮喘气道炎症、MnSOD、PINK1-Parkin蛋白水平、以LC3和Parkin在气道中共定位为特征的Parkin介导的线粒体自噬、ROS生成、NLRP3炎症及细胞凋亡均被完全逆转。rmDEK的类似效应也在BEAS-2B细胞中观察到,且可被自噬抑制剂3-MA所挽救。此外,DEK沉默减少了Parkin、LC3、DRP1向线粒体的转位;以及线粒体ROS;TOM20和线粒体DNA介导的线粒体氧化损伤。ChIP测序分析显示,DEK富集于含AAA结构域的蛋白3A(ATAD3A)启动子上,并可正向调控ATAD3A表达。此外,ATAD3A在HDM诱导的哮喘模型中高表达。进一步研究发现,ATAD3A与DRP1相互作用,且敲低ATAD3A可下调DRP1及线粒体氧化损伤。综上所述,DEK缺
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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