持续性喘息儿童浆细胞样树突状细胞干扰素反应受损数据集

研究背景指出 pDC 作为 I 型干扰素的关键生产者,其抗病毒功能可能与幼儿反复喘息相关,但机制尚不明确。该数据可用于探索 pDC 表型与功能在喘息儿童中的变化,以及干扰

geo
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基因组分类GPL337589606
GSE243052: Impaired interferon response in plasmacytoid dendritic cells from children with persistent wheeze

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

持续性喘息儿童浆细胞样树突状细胞干扰素反应受损数据集

Impaired interferon response in plasmacytoid dendritic cells from children with persistent wheeze

该数据集来自 NCBI GEO,标题为“Impaired interferon response in plasmacytoid dendritic cells from children with persistent wheeze”,聚焦于持续性喘息儿童浆细胞样树突状细胞(pDC)的干扰素反应受损现象。数据包含 1 个文件(GSE243052_series_matrix.txt.gz),基于高通量测序表达谱分析,涉及人类样本(9606)和平台 GPL33758。研究背景指出 pDC 作为 I 型干扰素的关键生产者,其抗病毒功能可能与幼儿反复喘息相关,但机制尚不明确。该数据可用于探索 pDC 表型与功能在喘息儿童中的变化,以及干扰。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 13 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:干扰素反应受损和过敏性致敏可能导致幼儿病毒诱发性喘息和哮喘发展。浆细胞样树突状细胞(pDC)作为 I 型干扰素(IFN-I)的关键生产者,在抗病毒免疫中发挥重要作用。pDC 还表达高亲和力 IgE 受体(FcεRI),通过该受体可能负向调节 IFN-I 的产生。pDC 的抗病毒功能是否与幼儿反复喘息发作相关尚不清楚。本研究旨在评估具有纵向定义喘息表型的儿童循环 pDC 的表型和功能。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL33758、9606。本站分类:呼吸系统疾病/哮喘。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE243052

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 18 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景 干扰素反应受损和过敏性致敏可能导致幼儿病毒诱发性喘息和哮喘的发生。浆细胞样树突状细胞(pDC)作为I型干扰素(IFN-I)的关键产生者,在抗病毒免疫中发挥重要作用。pDC还表达高亲和力IgE受体(FcεRI),通过该受体可能对IFN-I的产生进行负向调控。pDC的抗病毒功能是否与幼儿反复发作的喘息相关尚不清楚。本研究旨在评估具有纵向定义喘息表型的儿童循环pDC的表型和功能。方法 我们对38名因急性呼吸性喘息发作就诊于急诊科的儿童和19名对照者的外周血单个核细胞进行了多参数流式细胞术检测。同时对来自同一批个体的分离pDC进行了RNA测序。对于每个受试者,利用西澳大利亚公立医院数据库确定其纵向加重表型。结果 我们观察到在具有持续性喘息表型的幼儿中,循环pDC显著减少。

相同的个体在其pDC上也显示出IgE受体(FcεRI)的上调。基于转录组分析,这些个体的pDC未能像表现出非复发性喘息表型的儿童那样,发起强有力的系统性抗病毒反应。结论我们的数据表明,在具有持续性纵向加重表型的幼儿中,循环pDC的表型和功能发生了改变。在喘息急性加重期间,FcεRI的表达增加,而其作为主要IFN产生者的功能受损。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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