mRNA甲基转移酶Mettl3调控肥大细胞细胞因子mRNA稳定性并限制功能反应[NanoString]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE228493

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肥大细胞是过敏和哮喘的核心参与者，其失调反应会导致生活质量下降以及过敏性休克等危及生命的状况。RNA修饰N6-甲基腺苷（m6A）对免疫细胞功能具有显著影响，但其在肥大细胞中的作用尚未被探索。在此，通过优化对原代肥大细胞进行基因操作的工具，我们揭示了m6A mRNA甲基转移酶复合物调控肥大细胞的增殖与存活。催化组分Mettl3的缺失在体外和体内均加剧了针对IgE和抗原复合物的效应功能。机制上，Mettl3或Mettl14的缺失导致炎性细胞因子表达增强。通过聚焦于受影响最显著的mRNA之一，即编码细胞因子IL-13的mRNA，我们发现其在活化肥大细胞中被甲基化，且Mettl3以酶活性依赖的方式影响其转录本稳定性，这需要Il13 3‘-非翻译区中的共有m6A位点。总体而言，我们揭示了m6A机制在肥大细胞中对于维持生长和限制炎症反应至关重要。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。