阴离子肺表面活性脂质抑制人气道上皮鼻病毒A感染

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE226071

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数据说明

鼻病毒（RVs）是哮喘、慢性阻塞性肺疾病（COPD）及其他呼吸系统疾病急性加重的主要诱因。鼻病毒分为三个种（RV-A、RV-B和RV-C），包含160多种血清型，这使得开发有效疫苗十分困难。目前尚无针对鼻病毒感染的有效治疗方法。肺表面活性物质是由脂质和蛋白质组成的细胞外复合物，在调节肺部先天免疫中发挥核心作用。肺表面活性物质中的微量脂质——棕榈酰-油酰-磷脂酰甘油（POPG）和磷脂酰肌醇（PI）——是炎症过程的有效调节因子，并对呼吸道合胞病毒（RSV）和甲型流感病毒（IAV）具有抗病毒活性。在本研究中，我们在气液界面（ALI）分化培养的原代人气管上皮细胞（AECs）中检测了POPG和PI对鼻病毒A16（RV-A16）的作用效力。AECs感染RV-A16后，PI使病毒RNA拷贝数降低80%，并下调（55-65%）抗病毒基因（MDA5、IRF7和IFN-lambda）的表达。

相比之下，POPG仅轻微降低了MDA5（24%）和IRF7（11%）的基因表达，但未抑制气道上皮细胞（AECs）中IFN-λ基因表达或RV-A16复制。然而，POPG和PI均抑制（50-80%）IL6和CXCL11的基因表达及蛋白分泌。PI处理显著减弱了RV-A16感染在AECs中诱导的整体基因表达变化。对PI处理所拮抗的病毒调控基因进行细胞类型富集分析显示，PI抑制了病毒诱导的杯状细胞化生以及病毒诱导的纤毛细胞、棒状细胞和离子细胞类型下调。值得注意的是，PI处理改变了RV-A16调控某些磷脂酰肌醇4-激酶（PI4K）、含酰基辅酶A结合结构域（ACBD）及低密度脂蛋白受体（LDLR）基因表达的能力，这些基因在复制细胞器（ROs）的形成和功能中发挥关键作用，而ROs是

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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