GSE222894：靶向LIGHT的循环MicroRNAs作为哮喘发作诊断生物标志物

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE222894

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

支气管哮喘是最常见的呼吸系统疾病之一。可逆性气流受限、持续性气道炎症和气道高反应性以及气道重塑是其主要特征。空气污染导致哮喘的发病率和死亡率上升。MicroRNA是调节基因表达的小分子，在炎症性疾病中发挥作用。本研究旨在通过microRNA微阵列和实时PCR检测，比较和筛选靶向LIGHT的循环microRNA作为哮喘发作期间的诊断生物标志物。方法：采集40例哮喘发作患者和20名正常受试者的血清，通过miRNA微阵列检测循环microRNA表达谱。结果显示，哮喘患者与正常对照之间的microRNA水平存在显著差异。基于TargetScan生物信息学软件，对差异表达microRNA进行靶基因预测分析，以筛选靶向LIGHT基因的miRNA。进行实时PCR以进一步验证miRNA微阵列的可靠性以及筛选出的靶向LIGHT的特异性miRNA。

结果：与健康受试者相比，哮喘患者的miR-512-3p、miR-513b-5p、miR-5691表达显著上调，而miR-107、miR-140-5p、miR-17-5p水平较低。哮喘患者血浆中miR-140-5p和miR-107的水平与其嗜酸性粒细胞炎症密切相关。血浆miR-140-5p和miR-107需进一步研究，以评估其作为哮喘诊断生物标志物的作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。