IL-33诱导肥大细胞抗病毒特征但增强人鼻病毒易感性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE216269

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数据说明

肥大细胞（MCs）传统上与过敏性哮喘相关，但其在抗病毒免疫中的作用尚不清楚。人鼻病毒（HRVs）是哮喘急性发作的主要原因，并可在肥大细胞内感染和复制。HRV感染的主要部位是气道上皮，而随着哮喘严重程度的增加，肥大细胞定位于该部位。哮喘易感基因IL-33编码一种上皮来源的细胞因子，在HRV感染后释放，但其对肥大细胞抗病毒反应的影响尚未确定。在本研究中，我们利用RNA测序研究了LAD2肥大细胞对IL-33刺激的整体反应，并鉴定了参与抗病毒免疫的基因。尽管如此，IL-33处理增加了肥大细胞对HRV16感染的易感性，根据RNA-Seq数据，我们将其归因于ICAM1的上调。流式细胞术分析证实，IL-33依赖性增加了ICAM1的表面表达，以及LDLR的表达，这两种受体分别被主要组和次要组HRV用于细胞进入。ICAM1的中和减少了LAD2肥大细胞和脐血来源肥大细胞中IL-33依赖性的HRV16复制和释放增强。

这些发现表明，尽管IL-33在肥大细胞中诱导了抗病毒特征，但它也上调了鼻病毒（HRV）进入受体，从而增强了感染。这突显了肥大细胞中IL33与HRV之间基因-环境相互作用的潜力，可能促成病毒诱发的哮喘加重。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。