儿科重症监护病房哮喘患儿血浆细胞因子聚类分析与中性粒细胞转录组分析
该数据集来自 NCBI GEO(GSE208220),聚焦儿科重症监护病房中的重症哮喘患儿。研究基于血浆细胞因子浓度对患儿进行聚类分析,并利用靶向 Nanostring 免疫学芯片比较两个聚类之间的基因表达差异,同时涉及中性粒细胞转录组分析

基本信息
资源简介
儿科重症监护病房哮喘患儿血浆细胞因子聚类分析与中性粒细胞转录组分析
Cluster Analysis of Plasma Cytokines and Neutrophil Transcriptomic Profiling of Children with Asthma in the Pediatric Intensive Care Unit
该数据集来自 NCBI GEO(GSE208220),聚焦儿科重症监护病房中的重症哮喘患儿。研究基于血浆细胞因子浓度对患儿进行聚类分析,并利用靶向 Nanostring 免疫学芯片比较两个聚类之间的基因表达差异,同时涉及中性粒细胞转录组分析。数据包含 1 个文件(GSE208220_series_matrix.txt.gz),属于表达谱芯片数据,可用于探索重症哮喘的分子分型及中性粒细胞相关转录特征(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 14 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们确定是否可以通过血浆细胞因子浓度识别重症哮喘患儿的聚类。使用靶向 Nanostring 免疫学芯片分析两个聚类之间的基因表达差异。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL21847、9606。本站分类:呼吸系统疾病/哮喘。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE208220
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 14 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE208220
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们通过血浆细胞因子浓度判断能否识别出儿童危重症哮喘的聚类。采用靶向Nanostring免疫学芯片分析两个聚类之间的基因表达差异。我们开展了一项单中心、前瞻性、观察性队列研究,纳入2019年7月至2021年2月期间因哮喘发作入住儿科重症监护室的64名6至17岁儿童。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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