IMSA队列健康、中度哮喘与重度哮喘患者外周血基因表达
该数据集来自IMSA队列,包含健康人、中度哮喘和重度哮喘患者的外周血全血样本,利用下一代测序(NGS)技术检测mRNA序列的基因表达

基本信息
资源简介
IMSA队列健康、中度哮喘与重度哮喘患者外周血基因表达
GSE207751 数据集收录了来自 IMSA 队列的外周血基因表达数据,涵盖健康人群、中度哮喘患者与重度哮喘患者三类研究对象。该数据集通过下一代测序(NGS)技术对全外周血样本中的 mRNA 序列进行检测,用于识别和刻画不同临床疾病严重程度下哮喘患者的基因表达特征。数据集归属于呼吸系统疾病中的哮喘方向,源站为 ncbi.nlm.nih.gov,共包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE207751_series_matrix.txt.gz。该数据集可为哮喘严重程度的分子层面研究提供外周血转录组层面的数据基础。
【数据集背景】
哮喘是一种异质性呼吸系统疾病,不同患者在临床严重程度上存在明显差异。为在分子层面理解这种差异,需要在不同疾病严重程度的人群中系统检测基因表达。GSE207751 正是围绕这一需求而建立:其源站描述指出,该数据集旨在利用下一代测序技术对全外周血 mRNA 序列进行基因表达鉴定与特征刻画,样本来自临床疾病严重程度各异的哮喘患者。数据集所属的 IMSA 队列为其提供了健康人、中度哮喘与重度哮喘三类研究对象的样本框架,使研究者能够在同一数据集中比较不同严重程度组别之间的基因表达状况。
【数据内容】
该数据集的内容为外周血全血的基因表达数据,检测对象为 mRNA 序列,检测手段为下一代测序。数据覆盖三类人群:健康人、中度哮喘患者和重度哮喘患者。数据集共包含 1 个文件,样例文件名为 GSE207751_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。主题标签显示其属于“Expression profiling by high throughput sequencing”,并标注了 GPL18573 平台与 9606(人类)物种信息。数据集作者为 Scott、Ginebaugh,发布时间为 Jul 08 202。
【采集与来源】
数据来源于 IMSA 队列,样本为哮喘患者及健康人的全外周血。源站描述说明,基因表达检测采用下一代测序技术对 mRNA 序列进行测序。数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,本站将其归类于呼吸系统疾病 / 哮喘方向。关于样本采集的具体流程、伦理审批信息以及测序平台的操作细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于比较健康人群、中度哮喘患者与重度哮喘患者之间外周血基因表达的差异,可用于探索与哮喘临床严重程度相关的基因表达特征。由于数据基于全外周血 mRNA 测序,适合开展转录组层面的表达谱分析。关于该数据集在特定研究设计中的具体适用性,源站未提供进一步说明。
【使用方法】
使用该数据集时,可先下载数据文件 GSE207751_series_matrix.txt.gz,并按 GZIP 压缩包的格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因格式或编码问题导致后续分析出错。关于数据的具体字段含义、预处理步骤与标准化方法,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件,样本覆盖健康、中度哮喘与重度哮喘三类人群,数据来源为 IMSA 队列。关于数据质量评估指标、批次效应、样本量大小以及潜在偏倚等信息,源站未提供。使用时应注意其数据规模与来源的局限性,具体限制条件源站未提供。
【引用与许可】
数据集作者为 Scott、Ginebaugh,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用格式、使用许可与再分发条件,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE207751
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
利用下一代测序(NGS)技术,对来自不同临床疾病严重程度的哮喘患者全外周血mRNA序列进行基因表达的鉴定与特征分析
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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