肠道细菌来源12,13-diHOME促进M1样炎症巨噬细胞极化及靶向干扰素应答的训练免疫 [h-Mf-ATAC-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE207491

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数据说明

婴儿粪便中细菌来源的脂质12,13-diHOME浓度升高会增加儿童期特应性和哮喘发生的风险，但该脂质促进疾病易感性的机制尚不清楚。本研究表明，暴露于12,13-diHOME的巨噬细胞表现出炎症性IL-1β高CD206低的M1样极化，并降低细菌吞噬能力。在共培养实验中，12,13-diHOME存在下的抗原进一步放大了M1样频率，促进CD20+CD38-IgD-CD27+记忆B细胞扩增和IgE产生。表观遗传学分析表明，12,13-diHOME暴露促进DNA甲基化、染色质压缩，特别是减少了干扰素刺激反应元件和转录因子结合位点的可及性。在体内小鼠气道过敏性致敏模型中，肠道细菌来源的12,13-diHOME加重了气道过敏性炎症以及IL-1、IL-7、一碳代谢和Toll样受体信号传导。

我们的数据表明，12,13-diHOME重编程巨噬细胞效应功能、B细胞相互作用及表观遗传修饰，从而促进可能在塑造生命早期微生物组发育及与儿童期过敏性致敏相关的先天免疫功能障碍中发挥作用的表型。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。