转录因子Zfp281与Zfp148冗余支持CD4+ T细胞发育和功能[scRNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE206521

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

转录因子Gata3对于胸腺中CD4+ T细胞的发育以及Th2细胞的分化都是必不可少的，Th2细胞介导针对胞外寄生虫的反应，并参与哮喘和过敏的发生。在此我们报道，转录因子Zfp281与其旁系同源物Zfp148部分冗余地协同Gata3促进CD4+ T细胞发育和Th2细胞分化。在T细胞中同时破坏这两个因子会导致脾脏CD4+ T细胞数量减少。此外，我们还发现Zfp281与Gata3相互作用，且Zfp281在Th2细胞中结合于Th2细胞因子基因座。最后，我们发现Zfp148和Zfp281促进Th2细胞因子的表达。在气道炎症过程中，Zfp148/281缺陷的CD4+ T细胞尽管Gata3表达正常，却无法表达Th2细胞因子。总之，我们的数据表明Zfp148和Zfp281对于使Gata3在CD4+ T细胞发育和Th2功能中发挥作用是必不可少的。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。