GSE205876:EBCs中的miRNA表达
该数据集来自NCBI,收录呼出气冷凝物(EBCs)中miRNA表达数据,样本涉及镰状细胞病、哮喘、镰状细胞病合并哮喘的儿科患者及对照

基本信息
资源简介
GSE205876:EBCs中的miRNA表达
GSE205876 是一个聚焦呼吸系统疾病与哮喘方向的基因表达数据集,原始标题为 miRNA expression in EBCs,来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov)。该数据集收录了呼出气冷凝物(EBCs)中的 miRNA 表达谱数据,样本涉及镰状细胞病、哮喘、镰状细胞病合并哮喘的儿科患者以及对照人群。数据集由 Patricia Silveyra 提交,发布时间为 Jun 10 202,共包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE205876_series_matrix.txt.gz。整体来看,该数据集以 RT-PCR 表达谱分析为主要技术路线,适合关注儿科呼吸系统疾病中 miRNA 表达变化的研究者参考使用。
【数据集背景】
该数据集围绕呼出气冷凝物这一相对无创的呼吸道样本类型展开,关注 miRNA 在其中的表达情况。源站描述指出,研究者分析了儿科患者呼出气冷凝物中的 miRNA 表达,涉及的受试群体包括镰状细胞病患者、哮喘患者、镰状细胞病合并哮喘患者以及对照。数据集在本站被归类为呼吸系统疾病 / 哮喘,主题标签中包含 Expression profiling by RT-PCR、GPL26552 与 9606,说明其表达谱分析基于 RT-PCR 平台,物种信息对应人类。
【数据内容】
数据集共包含 1 个文件,样例文件名为 GSE205876_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。该文件为系列矩阵文件,通常用于承载样本层面的表达数据及其相关注释信息。数据集的主题标签表明其属于 RT-PCR 表达谱分析类型,并关联平台 GPL26552。除上述文件与标签信息外,源站未提供更细化的数据内容说明。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为 miRNA expression in EBCs。样本采集对象为儿科患者,样本类型为呼出气冷凝物,分组涵盖镰状细胞病、哮喘、镰状细胞病合并哮喘以及对照。数据集作者为 Patricia Silveyra,发布时间为 Jun 10 202。关于具体的采集流程、样本量、临床信息等细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于研究呼出气冷凝物中 miRNA 的表达特征,比较镰状细胞病、哮喘、镰状细胞病合并哮喘患儿与对照之间的表达差异,也可作为呼吸系统疾病与哮喘相关表达谱分析的参考数据。其 RT-PCR 表达谱属性使其适合用于候选 miRNA 的验证性分析或小规模表达谱研究。具体适用场景的边界需结合数据实际内容判断,源站未提供更多说明。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE205876_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因格式或编码问题导致解析错误。关于数据预处理、归一化等具体步骤,源站未提供。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件,样本涉及多组儿科人群,但源站未提供样本量、重复数、质控指标等质量相关信息。使用时应关注呼出气冷凝物样本本身的变异来源以及 RT-PCR 平台的特性。受限于源站描述,数据集的完整性与适用范围需使用者自行评估。
【引用与许可】
数据集作者为 Patricia Silveyra,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用格式与许可条款,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE205876
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们分析了来自镰状细胞病、哮喘、镰状细胞病合并哮喘的儿科患者以及对照组的呼出气冷凝物中miRNAs的表达。
数据缺失?
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