GSE205876:EBCs中的miRNA表达

该数据集来自NCBI,收录呼出气冷凝物(EBCs)中miRNA表达数据,样本涉及镰状细胞病、哮喘、镰状细胞病合并哮喘的儿科患者及对照

geo
浏览 9
基因组分类Expression profiling by RT-PCRGPL265529606
GSE205876: miRNA expression in EBCs

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

GSE205876:EBCs中的miRNA表达

GSE205876 是一个聚焦呼吸系统疾病与哮喘方向的基因表达数据集,原始标题为 miRNA expression in EBCs,来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov)。该数据集收录了呼出气冷凝物(EBCs)中的 miRNA 表达谱数据,样本涉及镰状细胞病、哮喘、镰状细胞病合并哮喘的儿科患者以及对照人群。数据集由 Patricia Silveyra 提交,发布时间为 Jun 10 202,共包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE205876_series_matrix.txt.gz。整体来看,该数据集以 RT-PCR 表达谱分析为主要技术路线,适合关注儿科呼吸系统疾病中 miRNA 表达变化的研究者参考使用。

【数据集背景】

该数据集围绕呼出气冷凝物这一相对无创的呼吸道样本类型展开,关注 miRNA 在其中的表达情况。源站描述指出,研究者分析了儿科患者呼出气冷凝物中的 miRNA 表达,涉及的受试群体包括镰状细胞病患者、哮喘患者、镰状细胞病合并哮喘患者以及对照。数据集在本站被归类为呼吸系统疾病 / 哮喘,主题标签中包含 Expression profiling by RT-PCR、GPL26552 与 9606,说明其表达谱分析基于 RT-PCR 平台,物种信息对应人类。

【数据内容】

数据集共包含 1 个文件,样例文件名为 GSE205876_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。该文件为系列矩阵文件,通常用于承载样本层面的表达数据及其相关注释信息。数据集的主题标签表明其属于 RT-PCR 表达谱分析类型,并关联平台 GPL26552。除上述文件与标签信息外,源站未提供更细化的数据内容说明。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为 miRNA expression in EBCs。样本采集对象为儿科患者,样本类型为呼出气冷凝物,分组涵盖镰状细胞病、哮喘、镰状细胞病合并哮喘以及对照。数据集作者为 Patricia Silveyra,发布时间为 Jun 10 202。关于具体的采集流程、样本量、临床信息等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于研究呼出气冷凝物中 miRNA 的表达特征,比较镰状细胞病、哮喘、镰状细胞病合并哮喘患儿与对照之间的表达差异,也可作为呼吸系统疾病与哮喘相关表达谱分析的参考数据。其 RT-PCR 表达谱属性使其适合用于候选 miRNA 的验证性分析或小规模表达谱研究。具体适用场景的边界需结合数据实际内容判断,源站未提供更多说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE205876_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因格式或编码问题导致解析错误。关于数据预处理、归一化等具体步骤,源站未提供。

【质量与限制】

数据集仅包含 1 个文件,样本涉及多组儿科人群,但源站未提供样本量、重复数、质控指标等质量相关信息。使用时应关注呼出气冷凝物样本本身的变异来源以及 RT-PCR 平台的特性。受限于源站描述,数据集的完整性与适用范围需使用者自行评估。

【引用与许可】

数据集作者为 Patricia Silveyra,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用格式与许可条款,源站未提供。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE205876

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们分析了来自镰状细胞病、哮喘、镰状细胞病合并哮喘的儿科患者以及对照组的呼出气冷凝物中miRNAs的表达。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案