小鼠驻留肺嗜酸性粒细胞依赖IL-5

源站描述指出研究目的是在小鼠哮喘模型中表征嗜酸性粒细胞。数据集包含 1 个文件,样例为 GSE203225_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及高通量测序表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台为 GPL30172

geo
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基因组分类GPL3017210090
GSE203225: Mouse resident lung eosinophils are dependent on IL-5

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

小鼠驻留肺嗜酸性粒细胞依赖IL-5

GSE203225 是一个来源于 NCBI GEO 的基因表达数据集,英文标题为“Mouse resident lung eosinophils are dependent on IL-5”,中文可译为“小鼠肺驻留嗜酸性粒细胞依赖 IL-5”。该数据集归属于呼吸系统疾病 / 哮喘分类,研究聚焦于小鼠哮喘模型中的嗜酸性粒细胞。源站描述表明,研究目的是在小鼠哮喘模型中对嗜酸性粒细胞进行表征。数据集共包含 1 个文件,样例文件为 GSE203225_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及高通量测序表达谱分析,物种为小鼠(分类编号 10090),平台为 GPL30172。作者为 Guy、Shapira,发布时间为 May 17 202。整体而言,该数据集为研究肺驻留嗜酸性粒细胞与 IL-5 依赖关系以及哮喘相关免疫机制提供了表达谱层面的数据基础。

【数据集背景】

该数据集围绕呼吸系统疾病中的哮喘展开,研究主题为小鼠肺驻留嗜酸性粒细胞对 IL-5 的依赖性。源站描述明确指出,研究目的在于对小鼠哮喘模型中的嗜酸性粒细胞进行表征。嗜酸性粒细胞是哮喘等过敏性气道炎症中的关键效应细胞,而 IL-5 是调控嗜酸性粒细胞分化、存活与募集的重要细胞因子,因此该数据集所对应的研究背景与哮喘发病机制中的嗜酸性粒细胞生物学密切相关。数据集由 Guy、Shapira 提交,发布时间为 May 17 202,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE203225_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。主题标签包括“Expression profiling by high throughput sequencing”,表明数据属于高通量测序表达谱分析类型;物种标签为 10090,对应小鼠;平台标签为 GPL30172。文件以 series matrix 形式组织,通常用于承载样本层面的表达谱矩阵及样本注释信息。除上述文件信息外,源站未提供更细化的样本数量、分组设计或基因层面内容说明。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI GEO 数据库,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。数据集标题与源站标题一致,均为“Mouse resident lung eosinophils are dependent on IL-5”。作者信息为 Guy、Shapira,发布时间为 May 17 202。物种为小鼠(10090),检测平台为 GPL30172,数据产生方式为高通量测序表达谱分析。关于具体实验动物模型构建、样本采集与测序流程的细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于哮喘相关研究中嗜酸性粒细胞表达谱的探索性分析,尤其适合关注小鼠哮喘模型中肺驻留嗜酸性粒细胞与 IL-5 依赖关系的课题。由于主题标签指向高通量测序表达谱分析,可用于差异表达分析、样本间表达模式比较等通用表达谱研究用途。数据集的小鼠物种背景也使其可用于与小鼠免疫学、呼吸系统疾病相关的交叉验证或方法学测试。具体适用性仍需结合源站提供的实验设计信息判断,源站未提供更详细的适用说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE203225_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段结构与编码方式,确认无误后再批量接入分析流程。由于文件为 series matrix 形式,读取后应关注样本注释与表达值矩阵的组织方式。关于平台注释文件、标准化方法或推荐分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

数据集仅包含 1 个文件,文件数量有限,可能限制对样本层级信息的独立核查。源站描述较为简短,仅说明研究目的为在小鼠哮喘模型中表征嗜酸性粒细胞,未提供样本量、重复数、测序深度、质控指标等质量相关信息。发布时间标注为 May 17 202,年份信息不完整。除主题标签与平台编号外,源站未提供更详细的技术参数,因此使用前应结合原始记录核实数据完整性与适用性。

【引用与许可】

数据集作者为 Guy、Shapira,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用格式、使用许可及再分发条件,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据时,应遵循来源站 NCBI GEO 的相关政策与作者要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE203225

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的:我们旨在表征哮喘小鼠模型中的嗜酸性粒细胞。方法:从初始小鼠和HDM诱导的哮喘小鼠肺部分选嗜酸性粒细胞。随后从分选的嗜酸性粒细胞中提取RNA并进行RNAseq。结果:我们证明驻留肺嗜酸性粒细胞的存活需要IL-5,且Siglec-F的表达受IL-5调控。结论:我们的数据表明,哮喘肺中不同的嗜酸性粒细胞群体代表的是激活状态的连续谱,而非不同的嗜酸性粒细胞亚群。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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