鼻病毒诱导的基因表达模式区分中性粒细胞性哮喘与其他哮喘炎症表型(人外周血单个核细胞)
该数据集来自 NCBI GEO(GSE202216),包含人外周血单个核细胞在鼻病毒刺激下的基因表达谱数据,用于区分中性粒细胞性哮喘与其他哮喘炎症表型

基本信息
资源简介
鼻病毒诱导的基因表达模式区分中性粒细胞性哮喘与其他哮喘炎症表型(人外周血单个核细胞)
Rhinovirus-induced gene expression patterns that distinguish between neutrophilic asthma and other asthma inflammatory phenotypes in human peripheral blood mononuclear cells
该数据集来自 NCBI GEO(GSE202216),包含人外周血单个核细胞在鼻病毒刺激下的基因表达谱数据,用于区分中性粒细胞性哮喘与其他哮喘炎症表型。数据以高通量测序表达谱形式提供,共 1 个文件(GSE202216_series_matrix.txt.gz),物种为人(9606),平台为 GPL23227。研究假设未刺激细胞的基因表达模式价值有限,而鼻病毒刺激后差异更明显,因此该数据可用于哮喘表型的分类建模与差异表达分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 04 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:本研究的目的是利用循环免疫细胞来定义最能区分不同哮喘表型的基因表达模式。我们假设分析未刺激细胞的基因表达模式价值有限,而基因表达模式的变异在 RV 刺激条件下最为明显。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL23227、9606。本站分类:呼吸系统疾病/哮喘。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE202216
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- OpenDataLab:
数据说明
目的:本研究旨在利用循环免疫细胞来确定最能区分不同哮喘表型的基因表达模式。我们假设,分析未刺激细胞中的基因表达模式价值有限,而基因表达模式的变异在RV刺激条件下最为明显。方法:将不同炎症亚型持续性哮喘成人的外周血单个核细胞样本在体外经RV刺激,采用RNA测序和生物信息学方法确定基因表达模式。结果:RV诱导的基因表达变化在中性粒细胞性哮喘(NA)与其他哮喘表型之间差异显著。与其他表型相比,NA中多种抗病毒免疫通路及其调节基因的表达下调,同时趋化因子基因、促炎细胞因子和Y染色体连锁基因的表达增强。这些变化在循环的骨髓来源免疫细胞中可被检测到,且在RV刺激的细胞中比静息细胞更为明显。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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