痰液microRNA筛查揭示前列腺素EP3受体作为过敏原特异性免疫治疗的选择性靶点

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE184382

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数据说明

已有若干微小RNA（miR）被描述为液体活检中的潜在生物标志物，并在过敏性哮喘背景下受到关注，而其对气道miR表达的治疗作用仍不明确。本研究在草花粉过敏患者（伴或不伴过敏原特异性免疫治疗，AIT）的痰液中探讨了与miR相关的表观遗传机制。我们采用miR微阵列和转录组微阵列分析，对健康对照（HC）、接受AIT治疗和未接受AIT治疗的草花粉过敏性鼻炎患者（伴哮喘者AA、不伴哮喘者AR）的诱导痰样本进行了同一批样本的谱分析。通过计算机预测miR靶标，并用于识别反向调控关系。采用ELISA法测定局部PGE2水平。与HC相比，AA患者痰液中有259个miR上调，仅1个下调。在接受AIT治疗患者的诱导痰中观察到相反的情况：哮喘患者接受AIT后，有21个miR下调，仅4个miR上调。在这4个miR中，miR3935尤为突出，因为其预测靶标PTGER3（前列腺素EP3受体）在接受治疗的AA患者中较未治疗者下调。

在这些样本的痰上清液中，过敏性患者（尤其是哮喘患者）的配体PGE2水平升高，而在AIT后下调。最后，局部PGE2水平与ILC2频率、分泌的痰液IL13水平、炎症细胞负荷、痰嗜酸性粒细胞及症状负担相关。在分析过敏性患者痰液以寻找新的miR表达模式时，我们发现miR3935与其预测靶基因前列腺素E3受体之间存在关联，后者可能通过抑制PGE2-PTGER3轴介导AIT效应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。