全基因组CRISPR筛选揭示整合素avb3在TH2细胞极化中的关键作用[RNA-seq I]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE179207

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

辅助性T细胞2（TH2）在抵御寄生蠕虫感染的保护性免疫以及组织修复中发挥关键作用。然而，TH2细胞应答的误导向会促进过敏和哮喘。通过在发育中的TH2细胞中进行全基因组CRISPR-Cas9筛选，我们定义了用于TH2分化的功能性TH2ome，并验证了一系列此前未与TH2细胞发育和功能相关联的多种分子。引人注目的是，我们发现整合素αvβ3在TH2细胞的差异极化及其2型细胞因子表达中发挥关键且此前未被充分认识的作用。相反，我们未鉴定出介导TCR连接后由内向外信号传导、作为T细胞突触一部分并优先促进TH1分化的LFA-1整合素。我们发现，TH2细胞表达整合素αvβ3对于形成表现出增强T细胞活化的TH2细胞簇是必需的，从而促进增殖和TH2细胞分化，进而增强抗原驱动的TH2细胞应答。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。