过敏原特异性免疫治疗诱导下气道细胞中抑制性secretoglobin 1A1
研究在花粉高峰季诱导花粉症患者与健康对照的痰液,按是否接受有效过敏原特异性免疫治疗(AIT)分层,比较痰液转录组,并在三年 AIT 疗程的三个时间点检测鼻分泌物中 SCGB1A1 与 IL-24 蛋白水平

基本信息
资源简介
过敏原特异性免疫治疗诱导下气道细胞中抑制性secretoglobin 1A1
Allergen-specific immunotherapy induces the suppressive secretoglobin 1A1 in cells of the lower airways
该数据集来自 NCBI GEO(GSE167225),包含 1 个文件 GSE167225_series_matrix.txt.gz,基于 GPL13607 芯片平台对人类(9606)样本进行全转录组表达谱分析。研究在花粉高峰季诱导花粉症患者与健康对照的痰液,按是否接受有效过敏原特异性免疫治疗(AIT)分层,比较痰液转录组,并在三年 AIT 疗程的三个时间点检测鼻分泌物中 SCGB1A1 与 IL-24 蛋白水平。数据可用于探索 AIT 在呼吸道局部及上皮层面的抗炎机制,并支持哮喘相关表达谱分类分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 22 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):虽然已发现过敏原特异性免疫治疗(AIT)的若干全身免疫调节效应,但呼吸道局部抗炎机制在很大程度上仍不清楚。我们试图以全基因组方法阐明过敏原特异性免疫治疗所涉及的局部与上皮机制。我们在花粉高峰季对花粉症患者和健康对照进行痰液诱导,并将患者按有效过敏原免疫治疗或未治疗进行分层。诱导后直接处理痰液并进行全转录组 RNA 微阵列分析。在一个额外验证队列中,于三年 AIT 疗程的三个明确时间点分析鼻分泌物中 Secretoglobin1A1(SCGB1A1)和 IL-24 蛋白水平。随后提取 RNA 并进行基于芯片的全转录组分析。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL13607、9606。本站分类:呼吸系统疾病/哮喘。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE167225
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 26 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
尽管已发现过敏原特异性免疫治疗(AIT)具有多种全身性免疫调节效应,但呼吸道局部抗炎机制在很大程度上仍不清楚。我们试图通过全基因组方法阐明过敏原特异性免疫治疗所涉及的局部及上皮机制。我们在花粉高峰期对枯草热患者和健康对照者进行诱导痰采集,并将患者按有效过敏原免疫治疗或未经治疗进行分层。诱导后直接处理痰液并进行全转录组RNA微阵列分析。在一个额外的验证队列中,于三年AIT疗程中的三个既定时间点分析鼻分泌物中Secretoglobin1A1(SCGB1A1)和IL-24蛋白水平。随后提取RNA并进行基于芯片的全转录组分析。AIT抑制促炎性CXCL8、IL24和CCL26 mRNA表达,而SCGB1A1、IL7、CCL5、CCL23和WNT5B mRNA的诱导则与哮喘状态和过敏原季节无关。
在我们的验证队列中,随着AIT疗程的推进,上气道局部SCGB1A1的增加与局部IL-24的减少同时发生。此外,SCGB1A1被鉴定为上皮基因表达的抑制因子。AIT在下气道诱导了一个迄今未知的局部基因表达足迹,该足迹一方面似乎是多种调控途径的结果,另一方面揭示了SCGB1A1作为长期过敏原特异性治疗干预在局部环境中的新型抗炎介质。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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