支气管热成形术治疗的重度哮喘患者支气管组织基因表达谱数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE159091

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

支气管热成形术（BT）是一种用于治疗难治性哮喘的内镜疗法。然而，目前尚无预测因素可用于确定BT治疗哮喘患者的有效性。本研究旨在全面分析8例接受BT治疗的严重哮喘患者气道支气管组织的RNA样本，并将每例患者特征化为BT应答者或非应答者。共获取24份RNA样本（每例患者在BT1前[基线]、BT2前[第1次治疗后]和BT3前[第2次治疗后]各3份）。8例患者支气管组织在BT1前（基线）与BT2前（第1次治疗后）之间有975个差异表达（DE）基因，差异具有显著性（FDR校正P<0.05）。12个月期间哮喘生活质量问卷评分变化>0.5的受试者被视为BT应答者。非应答者在12个月内的评分变化<0.5。

基线转录组分析鉴定出67个在应答者与非应答者之间差异表达的基因，包括在应答者中上调的SLPI、MMP3和MUC19。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。