补肾益气方治疗慢性哮喘小鼠的RNA-Seq表达分析及抗气道重塑调控基因靶点预测

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE155071

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

气道重塑是哮喘的典型病理特征之一。然而，哮喘气道结构变化复杂，阻碍了新型哮喘靶向治疗的发展。我们前期研究表明，补肾益气方（BSYQF）可通过调节肺部气道炎症和氧化应激改善慢性哮喘小鼠的气道重塑。为进一步探讨BSYQF的分子机制，本研究分析了对照组、哮喘小鼠伴/不伴BSYQF治疗的肺转录组。通过RNA测序分析，我们发现BSYQF治疗完全或部分逆转了一组在哮喘中诱导表达变化的基因。此外，基于前期结果，我们鉴定了21个差异表达基因（DEGs）。随后通过将21个DEGs输入Ingenuity Pathway Analysis（IPA）数据库构建基因网络，我们推断位于网络关键节点的Adipoq、SPP1和TNC可能是BSYQF抗重塑效应的关键调控因子。我们的结果为BSYQF在哮喘中抗重塑的分子机制提供了初步线索。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。