P2ry14缺陷与野生型小鼠肺嗜酸性粒细胞RNA-Seq

该数据集为GSE150347,来源于NCBI,包含P2ry14缺陷与野生型小鼠在蛋白酶诱导哮喘模型中的肺嗜酸性粒细胞转录组测序数据

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基因组分类GPL2424710090
GSE150347: Lung eosinophil RNA-Seq for P2ry14-deficient and wild-type mice

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

P2ry14缺陷与野生型小鼠肺嗜酸性粒细胞RNA-Seq

GSE150347 是一个面向呼吸系统疾病尤其是哮喘研究的高通量转录组测序数据集,来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),英文全称为 Lung eosinophil RNA-Seq for P2ry14-deficient and wild-type mice。该数据集围绕 P2ry14 基因充足(野生型)与 P2ry14 缺陷小鼠的肺嗜酸性粒细胞展开转录组分析,实验背景为蛋白酶诱导的哮喘模型。数据集由 Tadeusz P Karcz 提交,发布时间为 2020 年 5 月 11 日,归类于呼吸系统疾病 / 哮喘方向,主题涉及高通量测序表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台编号为 GPL24247。数据集共包含 1 个文件,样例文件为 GSE150347_series_matrix.txt.gz,可为研究嗜酸性粒细胞在哮喘中的转录特征及 P2ry14 基因功能提供原始表达谱资源。

【数据集背景】

哮喘是一种以气道炎症为特征的呼吸系统疾病,嗜酸性粒细胞在其发病过程中扮演重要角色。P2ry14 基因编码一种嘌呤能受体,其在肺嗜酸性粒细胞中的功能尚需在转录组层面加以刻画。该数据集正是针对这一需求,比较 P2ry14 充足与 P2ry14 缺陷小鼠在蛋白酶诱导哮喘模型下的肺嗜酸性粒细胞转录组,从而为理解该受体在嗜酸性粒细胞生物学及哮喘病理中的作用提供表达谱依据。源站将其归类于呼吸系统疾病 / 哮喘,主题标签为 Expression profiling by high throughput sequencing,物种为小鼠(10090),平台为 GPL24247。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE150347_series_matrix.txt.gz,属于系列矩阵文件,通常以表格形式组织样本与基因层面的表达信息。文件以 GZIP 压缩包形式提供。数据内容对应 P2ry14 充足与 P2ry14 缺陷小鼠肺嗜酸性粒细胞的 RNA-Seq 表达谱,实验背景为蛋白酶诱导的哮喘模型。关于矩阵中具体包含的样本数量、基因数量、分组细节及表达量单位等,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题为 Lung eosinophil RNA-Seq for P2ry14-deficient and wild-type mice,提交者为 Tadeusz P Karcz,发布时间为 2020 年 5 月 11 日。源站描述指出,该数据为蛋白酶哮喘模型中 P2ry14 充足与 P2ry14 缺陷小鼠肺嗜酸性粒细胞的转录组分析。平台信息标注为 GPL24247,物种为小鼠(10090)。关于具体测序平台型号、建库方法、测序深度及动物实验细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于呼吸系统疾病特别是哮喘方向的转录组研究,可用于比较 P2ry14 充足与缺陷小鼠肺嗜酸性粒细胞的基因表达差异,探索 P2ry14 在嗜酸性粒细胞功能及哮喘模型中的潜在作用。也可作为高通量测序表达谱分析的参考数据,用于方法学验证、候选基因筛选或与其他哮喘相关转录组数据的对照分析。由于数据聚焦于小鼠肺嗜酸性粒细胞,适合在动物模型层面开展机制探索性研究。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE150347_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。读取后可结合样本分组信息进行差异表达分析或表达模式比较。由于文件为系列矩阵形式,分析前应确认行列表头的含义及样本注释是否完整;若需更细粒度的原始测序数据,源站未提供相关说明。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件,数据规模有限,且以系列矩阵形式提供,可能不包含原始测序读段。关于样本重复数、测序质量、归一化方法及批次效应等信息,源站未提供。使用时应结合实验设计谨慎解释差异表达结果,避免过度推断。此外,数据基于小鼠蛋白酶诱导哮喘模型,向人类哮喘的转化需额外验证。

【引用与许可】

数据来源于 NCBI,提交者为 Tadeusz P Karcz,发布时间为 2020 年 5 月 11 日。关于该数据集的具体引用方式、许可条款及使用限制,源站未提供,使用前应查阅源站页面获取权威说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE150347

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Transcriptome analysis of P2ry14-sufficient and P2ry14-deficient mouse lung eosinophils in protease model of asthma.

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