过敏与哮喘中过敏原特异性T细胞的单细胞转录组分析

资源简介

过敏与哮喘中过敏原特异性T细胞的单细胞转录组分析

GSE146172 是一个聚焦过敏与哮喘的公开转录组数据集，全称为“Single-cell transcriptomic analysis of allergen-specific T cells in allergy and asthma”，即过敏与哮喘中过敏原特异性T细胞的单细胞转录组分析。该数据集来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），在本站归类于呼吸系统疾病 / 哮喘方向。其数据通过高通量测序开展表达谱分析，研究对象为人类（物种编号 9606），所用平台为 GPL16791。数据集由 Pandurangan 与 Vijayanand 提交，发布时间为 2020 年 3 月 2 日。数据集共包含 1 个文件，样例文件为 GSE146172_series_matrix.txt.gz，可供下载后用于本地读取与分析。整体而言，该数据集面向过敏性疾病与哮喘中过敏原特异性T细胞的单细胞水平表达特征研究，适合作为相关转录组分析的数据基础。

【数据集背景】

过敏与哮喘是常见的呼吸系统疾病，其免疫学机制涉及多种T细胞亚群对过敏原的特异性响应。单细胞转录组分析能够在单个细胞层面刻画细胞群体的异质性与表达特征，为理解过敏原特异性T细胞在过敏和哮喘中的作用提供数据支撑。GSE146172 正是围绕这一主题组织的数据集，其标题明确指向“过敏与哮喘中过敏原特异性T细胞的单细胞转录组分析”。该数据集在 NCBI 上以 SuperSeries 形式发布，源站描述指出该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成，说明其数据组织上具有分层结构，便于按子系列追溯具体实验内容。

【数据内容】

该数据集通过高通量测序进行表达谱分析（Expression profiling by high throughput sequencing），涉及人类样本，平台编号为 GPL16791。数据集当前提供的文件数量为 1，文件样例为 GSE146172_series_matrix.txt.gz，属于系列矩阵文件，通常用于汇总样本层面的表达信息。主题标签涵盖表达谱测序、平台 GPL16791 与物种 9606，这些信息共同界定了数据的技术类型与生物学对象。关于具体的样本数量、细胞数目、基因数目、分组设计及测序深度等细节，源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），源站标题与数据集英文名一致，均为“Single-cell transcriptomic analysis of allergen-specific T cells in allergy and asthma”。提交者为 Pandurangan 与 Vijayanand，发布时间为 2020 年 3 月 2 日。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成，未进一步展开各子系列的具体内容。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息及具体实验流程，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于过敏与哮喘相关的单细胞转录组表达谱分析，可用于探索过敏原特异性T细胞在疾病状态下的表达特征与群体异质性。由于数据通过高通量测序产生并涉及人类样本，其典型用途包括表达谱的读取、样本层面信息的核对以及在此基础上开展的转录组数据整合与比较分析。关于该数据集是否适用于特定临床分型、疗效预测或生物标志物验证等具体应用，源站未提供。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE146172_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩包格式。读取时应按文件格式进行解析，建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入后续分析流程。由于数据集仅提供 1 个文件，使用前应确认该文件所涵盖的样本与表达信息范围。关于具体的解析软件、参数设置及分析流程，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 SuperSeries，源站描述指出其由下列 SubSeries 组成，但未提供各子系列的详细说明，使用者在追溯具体实验与样本信息时可能受到限制。数据集仅包含 1 个文件，文件样例为系列矩阵文件，关于原始测序数据、质量控制指标、批次信息及缺失值情况，源站未提供。此外，样本量、细胞数量与测序深度等关键参数均未在现有信息中给出，使用时需自行核对文件内容。关于数据是否存在已知偏差或局限性，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的提交者为 Pandurangan 与 Vijayanand，发布时间为 2020 年 3 月 2 日，来源站为 NCBI。关于该数据集的具体引用文献、许可条款及使用限制，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前，应前往 NCBI 源站页面查阅相关的引用要求与使用政策。